Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P9

SPEF1, Sperm flagellar protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF1Q9Y4P9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF1Q9Y4P9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF1Q9Y4P9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPEF1Q9Y4P9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPEF1Q9Y4P9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPEF1Q9Y4P9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPEF1Q9Y4P9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPEF1Q9Y4P9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPEF1Q9Y4P9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPEF1Q9Y4P9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPEF1Q9Y4P9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPEF1Q9Y4P9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPEF1Q9Y4P9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPEF1Q9Y4P9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPEF1Q9Y4P9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPEF1Q9Y4P9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPEF1Q9Y4P9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPEF1Q9Y4P9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPEF1Q9Y4P9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPEF1Q9Y4P9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPEF1Q9Y4P9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPEF1Q9Y4P9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPEF1Q9Y4P9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPEF1Q9Y4P9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPEF1Q9Y4P9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPEF1Q9Y4P9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPEF1Q9Y4P9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPEF1Q9Y4P9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPEF1Q9Y4P9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPEF1Q9Y4P9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPEF1Q9Y4P9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPEF1Q9Y4P9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPEF1Q9Y4P9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPEF1Q9Y4P9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPEF1Q9Y4P9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPEF1Q9Y4P9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPEF1Q9Y4P9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPEF1Q9Y4P9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPEF1Q9Y4P9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPEF1Q9Y4P9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPEF1Q9Y4P9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPEF1Q9Y4P9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPEF1Q9Y4P9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPEF1Q9Y4P9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPEF1Q9Y4P9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPEF1Q9Y4P9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPEF1Q9Y4P9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPEF1Q9Y4P9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPEF1Q9Y4P9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms