Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT52Q9Y366 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT52Q9Y366 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT52Q9Y366 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT52Q9Y366 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT52Q9Y366 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT52Q9Y366 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT52Q9Y366 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT52Q9Y366 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT52Q9Y366 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT52Q9Y366 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT52Q9Y366 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT52Q9Y366 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT52Q9Y366 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT52Q9Y366 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT52Q9Y366 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT52Q9Y366 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT52Q9Y366 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT52Q9Y366 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT52Q9Y366 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT52Q9Y366 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT52Q9Y366 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT52Q9Y366 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT52Q9Y366 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT52Q9Y366 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT52Q9Y366 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT52Q9Y366 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT52Q9Y366 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT52Q9Y366 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT52Q9Y366 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT52Q9Y366 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT52Q9Y366 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
IFT52Q9Y366 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT52Q9Y366 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT52Q9Y366 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT52Q9Y366 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT52Q9Y366 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT52Q9Y366 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT52Q9Y366 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT52Q9Y366 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT52Q9Y366 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT52Q9Y366 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT52Q9Y366 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT52Q9Y366 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT52Q9Y366 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT52Q9Y366 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT52Q9Y366 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT52Q9Y366 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT52Q9Y366 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT52Q9Y366 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT52Q9Y366 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT52Q9Y366 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT52Q9Y366 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT52Q9Y366 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT52Q9Y366 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT52Q9Y366 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT52Q9Y366 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT52Q9Y366 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT52Q9Y366 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT52Q9Y366 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT52Q9Y366 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT52Q9Y366 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT52Q9Y366 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT52Q9Y366 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT52Q9Y366 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT52Q9Y366 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms