Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y333

LSM2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM2Q9Y333 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSM2Q9Y333 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSM2Q9Y333 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM2Q9Y333 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM2Q9Y333 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM2Q9Y333 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSM2Q9Y333 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM2Q9Y333 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM2Q9Y333 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM2Q9Y333 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM2Q9Y333 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM2Q9Y333 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LSM2Q9Y333 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM2Q9Y333 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM2Q9Y333 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM2Q9Y333 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM2Q9Y333 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM2Q9Y333 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM2Q9Y333 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM2Q9Y333 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM2Q9Y333 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM2Q9Y333 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM2Q9Y333 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM2Q9Y333 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM2Q9Y333 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM2Q9Y333 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM2Q9Y333 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM2Q9Y333 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM2Q9Y333 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LSM2Q9Y333 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LSM2Q9Y333 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LSM2Q9Y333 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM2Q9Y333 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LSM2Q9Y333 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM2Q9Y333 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM2Q9Y333 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM2Q9Y333 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM2Q9Y333 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM2Q9Y333 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM2Q9Y333 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM2Q9Y333 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM2Q9Y333 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM2Q9Y333 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM2Q9Y333 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM2Q9Y333 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM2Q9Y333 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM2Q9Y333 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM2Q9Y333 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM2Q9Y333 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM2Q9Y333 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM2Q9Y333 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM2Q9Y333 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM2Q9Y333 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM2Q9Y333 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM2Q9Y333 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM2Q9Y333 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM2Q9Y333 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM2Q9Y333 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM2Q9Y333 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM2Q9Y333 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM2Q9Y333 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms