Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SAMD4AQ9UPU9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAMD4AQ9UPU9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD4AQ9UPU9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD4AQ9UPU9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD4AQ9UPU9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMD4AQ9UPU9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMD4AQ9UPU9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMD4AQ9UPU9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMD4AQ9UPU9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMD4AQ9UPU9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMD4AQ9UPU9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMD4AQ9UPU9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMD4AQ9UPU9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMD4AQ9UPU9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMD4AQ9UPU9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMD4AQ9UPU9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMD4AQ9UPU9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAMD4AQ9UPU9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAMD4AQ9UPU9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAMD4AQ9UPU9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAMD4AQ9UPU9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMD4AQ9UPU9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMD4AQ9UPU9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMD4AQ9UPU9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMD4AQ9UPU9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMD4AQ9UPU9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMD4AQ9UPU9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMD4AQ9UPU9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD4AQ9UPU9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD4AQ9UPU9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMD4AQ9UPU9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMD4AQ9UPU9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMD4AQ9UPU9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMD4AQ9UPU9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMD4AQ9UPU9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMD4AQ9UPU9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMD4AQ9UPU9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMD4AQ9UPU9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMD4AQ9UPU9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMD4AQ9UPU9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMD4AQ9UPU9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMD4AQ9UPU9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SAMD4AQ9UPU9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms