Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCND1Q9NSA2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCND1Q9NSA2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCND1Q9NSA2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCND1Q9NSA2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCND1Q9NSA2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCND1Q9NSA2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCND1Q9NSA2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCND1Q9NSA2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCND1Q9NSA2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCND1Q9NSA2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCND1Q9NSA2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCND1Q9NSA2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCND1Q9NSA2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCND1Q9NSA2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCND1Q9NSA2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCND1Q9NSA2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCND1Q9NSA2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCND1Q9NSA2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCND1Q9NSA2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCND1Q9NSA2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCND1Q9NSA2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCND1Q9NSA2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCND1Q9NSA2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KCND1Q9NSA2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCND1Q9NSA2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCND1Q9NSA2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KCND1Q9NSA2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCND1Q9NSA2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCND1Q9NSA2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCND1Q9NSA2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCND1Q9NSA2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCND1Q9NSA2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCND1Q9NSA2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCND1Q9NSA2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCND1Q9NSA2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCND1Q9NSA2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCND1Q9NSA2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCND1Q9NSA2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCND1Q9NSA2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCND1Q9NSA2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCND1Q9NSA2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCND1Q9NSA2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCND1Q9NSA2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCND1Q9NSA2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCND1Q9NSA2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KCND1Q9NSA2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCND1Q9NSA2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCND1Q9NSA2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCND1Q9NSA2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCND1Q9NSA2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCND1Q9NSA2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KCND1Q9NSA2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCND1Q9NSA2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KCND1Q9NSA2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCND1Q9NSA2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCND1Q9NSA2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCND1Q9NSA2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCND1Q9NSA2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCND1Q9NSA2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCND1Q9NSA2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCND1Q9NSA2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCND1Q9NSA2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCND1Q9NSA2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCND1Q9NSA2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCND1Q9NSA2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCND1Q9NSA2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCND1Q9NSA2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCND1Q9NSA2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCND1Q9NSA2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCND1Q9NSA2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCND1Q9NSA2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCND1Q9NSA2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCND1Q9NSA2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms