Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLCO1B3Q9NPD5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLCO1B3Q9NPD5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLCO1B3Q9NPD5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLCO1B3Q9NPD5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLCO1B3Q9NPD5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLCO1B3Q9NPD5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLCO1B3Q9NPD5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLCO1B3Q9NPD5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLCO1B3Q9NPD5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLCO1B3Q9NPD5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLCO1B3Q9NPD5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLCO1B3Q9NPD5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLCO1B3Q9NPD5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLCO1B3Q9NPD5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLCO1B3Q9NPD5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLCO1B3Q9NPD5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLCO1B3Q9NPD5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLCO1B3Q9NPD5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLCO1B3Q9NPD5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLCO1B3Q9NPD5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLCO1B3Q9NPD5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLCO1B3Q9NPD5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLCO1B3Q9NPD5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLCO1B3Q9NPD5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLCO1B3Q9NPD5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLCO1B3Q9NPD5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLCO1B3Q9NPD5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLCO1B3Q9NPD5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLCO1B3Q9NPD5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLCO1B3Q9NPD5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLCO1B3Q9NPD5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLCO1B3Q9NPD5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLCO1B3Q9NPD5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLCO1B3Q9NPD5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLCO1B3Q9NPD5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLCO1B3Q9NPD5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLCO1B3Q9NPD5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLCO1B3Q9NPD5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLCO1B3Q9NPD5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLCO1B3Q9NPD5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLCO1B3Q9NPD5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLCO1B3Q9NPD5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLCO1B3Q9NPD5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLCO1B3Q9NPD5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLCO1B3Q9NPD5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms