Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SPEF2Q9C093 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SPEF2Q9C093 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SPEF2Q9C093 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SPEF2Q9C093 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SPEF2Q9C093 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SPEF2Q9C093 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SPEF2Q9C093 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SPEF2Q9C093 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SPEF2Q9C093 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SPEF2Q9C093 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SPEF2Q9C093 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SPEF2Q9C093 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SPEF2Q9C093 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SPEF2Q9C093 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SPEF2Q9C093 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SPEF2Q9C093 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SPEF2Q9C093 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SPEF2Q9C093 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SPEF2Q9C093 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SPEF2Q9C093 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SPEF2Q9C093 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SPEF2Q9C093 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SPEF2Q9C093 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SPEF2Q9C093 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SPEF2Q9C093 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SPEF2Q9C093 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPEF2Q9C093 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
SPEF2Q9C093 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPEF2Q9C093 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SPEF2Q9C093 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SPEF2Q9C093 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SPEF2Q9C093 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SPEF2Q9C093 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SPEF2Q9C093 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SPEF2Q9C093 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SPEF2Q9C093 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SPEF2Q9C093 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SPEF2Q9C093 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SPEF2Q9C093 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
SPEF2Q9C093 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SPEF2Q9C093 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SPEF2Q9C093 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SPEF2Q9C093 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SPEF2Q9C093 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SPEF2Q9C093 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SPEF2Q9C093 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SPEF2Q9C093 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SPEF2Q9C093 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SPEF2Q9C093 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPEF2Q9C093 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPEF2Q9C093 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPEF2Q9C093 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SPEF2Q9C093 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPEF2Q9C093 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPEF2Q9C093 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SPEF2Q9C093 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SPEF2Q9C093 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SPEF2Q9C093 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPEF2Q9C093 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPEF2Q9C093 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPEF2Q9C093 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPEF2Q9C093 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SPEF2Q9C093 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SPEF2Q9C093 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SPEF2Q9C093 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPEF2Q9C093 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SPEF2Q9C093 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SPEF2Q9C093 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SPEF2Q9C093 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SPEF2Q9C093 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SPEF2Q9C093 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SPEF2Q9C093 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SPEF2Q9C093 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SPEF2Q9C093 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SPEF2Q9C093 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SPEF2Q9C093 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SPEF2Q9C093 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SPEF2Q9C093 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SPEF2Q9C093 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SPEF2Q9C093 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SPEF2Q9C093 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms