Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI9

NRIP2, Nuclear receptor-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP2Q9BQI9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP2Q9BQI9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP2Q9BQI9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP2Q9BQI9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP2Q9BQI9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP2Q9BQI9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP2Q9BQI9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP2Q9BQI9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP2Q9BQI9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NRIP2Q9BQI9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRIP2Q9BQI9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NRIP2Q9BQI9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP2Q9BQI9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP2Q9BQI9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP2Q9BQI9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP2Q9BQI9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP2Q9BQI9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP2Q9BQI9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP2Q9BQI9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP2Q9BQI9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP2Q9BQI9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRIP2Q9BQI9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP2Q9BQI9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP2Q9BQI9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP2Q9BQI9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP2Q9BQI9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP2Q9BQI9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP2Q9BQI9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP2Q9BQI9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP2Q9BQI9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP2Q9BQI9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRIP2Q9BQI9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NRIP2Q9BQI9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP2Q9BQI9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP2Q9BQI9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP2Q9BQI9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP2Q9BQI9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP2Q9BQI9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP2Q9BQI9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP2Q9BQI9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP2Q9BQI9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP2Q9BQI9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP2Q9BQI9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1650.8 ms