Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGREF1Q99674 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGREF1Q99674 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGREF1Q99674 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGREF1Q99674 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGREF1Q99674 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGREF1Q99674 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGREF1Q99674 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGREF1Q99674 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGREF1Q99674 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGREF1Q99674 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGREF1Q99674 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGREF1Q99674 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGREF1Q99674 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGREF1Q99674 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGREF1Q99674 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGREF1Q99674 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGREF1Q99674 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CGREF1Q99674 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGREF1Q99674 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 327.3 ms