Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD180Q99467 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD180Q99467 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD180Q99467 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CD180Q99467 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD180Q99467 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD180Q99467 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD180Q99467 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD180Q99467 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CD180Q99467 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CD180Q99467 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD180Q99467 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD180Q99467 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD180Q99467 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD180Q99467 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD180Q99467 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD180Q99467 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD180Q99467 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD180Q99467 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD180Q99467 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD180Q99467 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CD180Q99467 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD180Q99467 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CD180Q99467 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CD180Q99467 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CD180Q99467 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CD180Q99467 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CD180Q99467 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CD180Q99467 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CD180Q99467 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CD180Q99467 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CD180Q99467 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CD180Q99467 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CD180Q99467 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD180Q99467 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CD180Q99467 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD180Q99467 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD180Q99467 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CD180Q99467 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD180Q99467 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD180Q99467 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD180Q99467 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CD180Q99467 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD180Q99467 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD180Q99467 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD180Q99467 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD180Q99467 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD180Q99467 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD180Q99467 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD180Q99467 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD180Q99467 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD180Q99467 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD180Q99467 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD180Q99467 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CD180Q99467 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD180Q99467 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD180Q99467 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD180Q99467 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD180Q99467 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD180Q99467 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD180Q99467 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD180Q99467 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD180Q99467 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD180Q99467 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CD180Q99467 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD180Q99467 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD180Q99467 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD180Q99467 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD180Q99467 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD180Q99467 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD180Q99467 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD180Q99467 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD180Q99467 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD180Q99467 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD180Q99467 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD180Q99467 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD180Q99467 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD180Q99467 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD180Q99467 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CD180Q99467 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD180Q99467 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD180Q99467 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD180Q99467 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD180Q99467 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CD180Q99467 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CD180Q99467 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD180Q99467 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CD180Q99467 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD180Q99467 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD180Q99467 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD180Q99467 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD180Q99467 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD180Q99467 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD180Q99467 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD180Q99467 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CD180Q99467 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD180Q99467 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD180Q99467 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD180Q99467 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD180Q99467 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms