Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF12Q96QT6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF12Q96QT6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF12Q96QT6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF12Q96QT6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF12Q96QT6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF12Q96QT6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF12Q96QT6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF12Q96QT6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF12Q96QT6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF12Q96QT6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF12Q96QT6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF12Q96QT6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF12Q96QT6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF12Q96QT6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF12Q96QT6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF12Q96QT6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF12Q96QT6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF12Q96QT6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF12Q96QT6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF12Q96QT6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF12Q96QT6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF12Q96QT6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF12Q96QT6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF12Q96QT6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF12Q96QT6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF12Q96QT6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF12Q96QT6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF12Q96QT6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF12Q96QT6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF12Q96QT6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF12Q96QT6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF12Q96QT6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF12Q96QT6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF12Q96QT6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF12Q96QT6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms