Protein–RNA interactions for Protein: Q96HB5

CCDC120, Coiled-coil domain-containing protein 120, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC120Q96HB5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.6 ms