Protein–RNA interactions for Protein: Q96HB5

CCDC120, Coiled-coil domain-containing protein 120, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC120Q96HB5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC120Q96HB5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC120Q96HB5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC120Q96HB5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms