Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPSB1Q96BD6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPSB1Q96BD6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPSB1Q96BD6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPSB1Q96BD6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPSB1Q96BD6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPSB1Q96BD6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPSB1Q96BD6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPSB1Q96BD6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPSB1Q96BD6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPSB1Q96BD6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPSB1Q96BD6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPSB1Q96BD6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPSB1Q96BD6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPSB1Q96BD6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPSB1Q96BD6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPSB1Q96BD6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPSB1Q96BD6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPSB1Q96BD6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPSB1Q96BD6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPSB1Q96BD6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPSB1Q96BD6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPSB1Q96BD6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPSB1Q96BD6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPSB1Q96BD6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPSB1Q96BD6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPSB1Q96BD6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPSB1Q96BD6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms