Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP6V1E2Q96A05 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP6V1E2Q96A05 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP6V1E2Q96A05 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP6V1E2Q96A05 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP6V1E2Q96A05 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP6V1E2Q96A05 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP6V1E2Q96A05 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP6V1E2Q96A05 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP6V1E2Q96A05 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP6V1E2Q96A05 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP6V1E2Q96A05 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP6V1E2Q96A05 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP6V1E2Q96A05 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP6V1E2Q96A05 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP6V1E2Q96A05 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP6V1E2Q96A05 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP6V1E2Q96A05 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP6V1E2Q96A05 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP6V1E2Q96A05 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP6V1E2Q96A05 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP6V1E2Q96A05 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP6V1E2Q96A05 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP6V1E2Q96A05 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP6V1E2Q96A05 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP6V1E2Q96A05 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP6V1E2Q96A05 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP6V1E2Q96A05 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP6V1E2Q96A05 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP6V1E2Q96A05 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP6V1E2Q96A05 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP6V1E2Q96A05 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP6V1E2Q96A05 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP6V1E2Q96A05 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP6V1E2Q96A05 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP6V1E2Q96A05 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP6V1E2Q96A05 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP6V1E2Q96A05 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP6V1E2Q96A05 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP6V1E2Q96A05 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP6V1E2Q96A05 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP6V1E2Q96A05 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP6V1E2Q96A05 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP6V1E2Q96A05 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP6V1E2Q96A05 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP6V1E2Q96A05 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP6V1E2Q96A05 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP6V1E2Q96A05 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP6V1E2Q96A05 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP6V1E2Q96A05 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP6V1E2Q96A05 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP6V1E2Q96A05 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP6V1E2Q96A05 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP6V1E2Q96A05 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP6V1E2Q96A05 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP6V1E2Q96A05 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP6V1E2Q96A05 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP6V1E2Q96A05 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP6V1E2Q96A05 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP6V1E2Q96A05 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP6V1E2Q96A05 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP6V1E2Q96A05 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP6V1E2Q96A05 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP6V1E2Q96A05 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP6V1E2Q96A05 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP6V1E2Q96A05 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP6V1E2Q96A05 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP6V1E2Q96A05 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms