Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SNX21Q969T3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SNX21Q969T3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SNX21Q969T3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SNX21Q969T3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SNX21Q969T3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SNX21Q969T3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SNX21Q969T3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SNX21Q969T3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SNX21Q969T3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SNX21Q969T3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SNX21Q969T3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
SNX21Q969T3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SNX21Q969T3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SNX21Q969T3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SNX21Q969T3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SNX21Q969T3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SNX21Q969T3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SNX21Q969T3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SNX21Q969T3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SNX21Q969T3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SNX21Q969T3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SNX21Q969T3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SNX21Q969T3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SNX21Q969T3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SNX21Q969T3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SNX21Q969T3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SNX21Q969T3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SNX21Q969T3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SNX21Q969T3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SNX21Q969T3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SNX21Q969T3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SNX21Q969T3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SNX21Q969T3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SNX21Q969T3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SNX21Q969T3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.53
SNX21Q969T3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SNX21Q969T3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SNX21Q969T3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SNX21Q969T3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SNX21Q969T3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SNX21Q969T3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SNX21Q969T3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SNX21Q969T3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SNX21Q969T3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SNX21Q969T3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SNX21Q969T3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SNX21Q969T3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SNX21Q969T3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SNX21Q969T3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SNX21Q969T3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SNX21Q969T3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SNX21Q969T3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SNX21Q969T3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SNX21Q969T3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SNX21Q969T3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SNX21Q969T3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SNX21Q969T3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SNX21Q969T3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SNX21Q969T3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SNX21Q969T3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SNX21Q969T3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SNX21Q969T3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SNX21Q969T3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SNX21Q969T3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SNX21Q969T3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SNX21Q969T3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SNX21Q969T3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SNX21Q969T3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SNX21Q969T3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SNX21Q969T3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SNX21Q969T3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SNX21Q969T3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SNX21Q969T3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SNX21Q969T3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SNX21Q969T3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SNX21Q969T3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms