Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFKQ969G6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFKQ969G6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFKQ969G6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFKQ969G6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFKQ969G6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFKQ969G6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFKQ969G6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFKQ969G6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFKQ969G6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFKQ969G6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFKQ969G6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFKQ969G6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFKQ969G6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFKQ969G6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFKQ969G6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFKQ969G6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFKQ969G6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFKQ969G6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFKQ969G6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFKQ969G6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFKQ969G6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RFKQ969G6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RFKQ969G6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFKQ969G6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFKQ969G6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFKQ969G6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFKQ969G6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFKQ969G6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFKQ969G6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFKQ969G6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFKQ969G6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFKQ969G6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFKQ969G6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFKQ969G6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFKQ969G6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFKQ969G6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFKQ969G6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFKQ969G6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFKQ969G6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFKQ969G6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFKQ969G6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFKQ969G6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFKQ969G6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFKQ969G6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFKQ969G6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFKQ969G6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFKQ969G6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFKQ969G6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFKQ969G6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFKQ969G6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFKQ969G6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFKQ969G6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFKQ969G6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFKQ969G6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFKQ969G6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFKQ969G6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFKQ969G6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFKQ969G6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFKQ969G6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFKQ969G6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFKQ969G6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFKQ969G6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFKQ969G6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFKQ969G6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFKQ969G6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFKQ969G6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFKQ969G6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RFKQ969G6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFKQ969G6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFKQ969G6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFKQ969G6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.5 ms