Protein–RNA interactions for Protein: Q8N431

RASGEF1C, Ras-GEF domain-containing family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1CQ8N431 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RASGEF1CQ8N431 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RASGEF1CQ8N431 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RASGEF1CQ8N431 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RASGEF1CQ8N431 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RASGEF1CQ8N431 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RASGEF1CQ8N431 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RASGEF1CQ8N431 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASGEF1CQ8N431 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RASGEF1CQ8N431 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RASGEF1CQ8N431 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RASGEF1CQ8N431 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RASGEF1CQ8N431 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RASGEF1CQ8N431 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RASGEF1CQ8N431 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RASGEF1CQ8N431 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RASGEF1CQ8N431 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RASGEF1CQ8N431 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RASGEF1CQ8N431 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RASGEF1CQ8N431 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RASGEF1CQ8N431 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASGEF1CQ8N431 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASGEF1CQ8N431 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASGEF1CQ8N431 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RASGEF1CQ8N431 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RASGEF1CQ8N431 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RASGEF1CQ8N431 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RASGEF1CQ8N431 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RASGEF1CQ8N431 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RASGEF1CQ8N431 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RASGEF1CQ8N431 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RASGEF1CQ8N431 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RASGEF1CQ8N431 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RASGEF1CQ8N431 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RASGEF1CQ8N431 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RASGEF1CQ8N431 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RASGEF1CQ8N431 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RASGEF1CQ8N431 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RASGEF1CQ8N431 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASGEF1CQ8N431 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASGEF1CQ8N431 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RASGEF1CQ8N431 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASGEF1CQ8N431 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASGEF1CQ8N431 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASGEF1CQ8N431 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASGEF1CQ8N431 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASGEF1CQ8N431 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASGEF1CQ8N431 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RASGEF1CQ8N431 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASGEF1CQ8N431 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASGEF1CQ8N431 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASGEF1CQ8N431 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms