Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VSTM4Q8IW00 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VSTM4Q8IW00 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VSTM4Q8IW00 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VSTM4Q8IW00 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VSTM4Q8IW00 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VSTM4Q8IW00 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VSTM4Q8IW00 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VSTM4Q8IW00 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
VSTM4Q8IW00 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VSTM4Q8IW00 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VSTM4Q8IW00 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VSTM4Q8IW00 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
VSTM4Q8IW00 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VSTM4Q8IW00 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VSTM4Q8IW00 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VSTM4Q8IW00 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VSTM4Q8IW00 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VSTM4Q8IW00 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VSTM4Q8IW00 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VSTM4Q8IW00 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VSTM4Q8IW00 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VSTM4Q8IW00 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VSTM4Q8IW00 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VSTM4Q8IW00 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VSTM4Q8IW00 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VSTM4Q8IW00 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
VSTM4Q8IW00 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VSTM4Q8IW00 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VSTM4Q8IW00 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VSTM4Q8IW00 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VSTM4Q8IW00 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VSTM4Q8IW00 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
VSTM4Q8IW00 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VSTM4Q8IW00 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VSTM4Q8IW00 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VSTM4Q8IW00 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VSTM4Q8IW00 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VSTM4Q8IW00 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VSTM4Q8IW00 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VSTM4Q8IW00 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VSTM4Q8IW00 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VSTM4Q8IW00 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VSTM4Q8IW00 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VSTM4Q8IW00 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VSTM4Q8IW00 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VSTM4Q8IW00 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VSTM4Q8IW00 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VSTM4Q8IW00 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
VSTM4Q8IW00 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VSTM4Q8IW00 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VSTM4Q8IW00 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VSTM4Q8IW00 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VSTM4Q8IW00 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VSTM4Q8IW00 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VSTM4Q8IW00 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VSTM4Q8IW00 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VSTM4Q8IW00 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VSTM4Q8IW00 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VSTM4Q8IW00 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VSTM4Q8IW00 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VSTM4Q8IW00 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VSTM4Q8IW00 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VSTM4Q8IW00 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VSTM4Q8IW00 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VSTM4Q8IW00 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
VSTM4Q8IW00 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
VSTM4Q8IW00 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VSTM4Q8IW00 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VSTM4Q8IW00 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VSTM4Q8IW00 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VSTM4Q8IW00 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VSTM4Q8IW00 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VSTM4Q8IW00 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VSTM4Q8IW00 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VSTM4Q8IW00 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VSTM4Q8IW00 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms