Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP5

FUNDC1, FUN14 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC1Q8IVP5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FUNDC1Q8IVP5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FUNDC1Q8IVP5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FUNDC1Q8IVP5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FUNDC1Q8IVP5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FUNDC1Q8IVP5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FUNDC1Q8IVP5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FUNDC1Q8IVP5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FUNDC1Q8IVP5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FUNDC1Q8IVP5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FUNDC1Q8IVP5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FUNDC1Q8IVP5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FUNDC1Q8IVP5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FUNDC1Q8IVP5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FUNDC1Q8IVP5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FUNDC1Q8IVP5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FUNDC1Q8IVP5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FUNDC1Q8IVP5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FUNDC1Q8IVP5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FUNDC1Q8IVP5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FUNDC1Q8IVP5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms