Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR53Q7Z5U6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR53Q7Z5U6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR53Q7Z5U6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR53Q7Z5U6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR53Q7Z5U6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR53Q7Z5U6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR53Q7Z5U6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR53Q7Z5U6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR53Q7Z5U6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR53Q7Z5U6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR53Q7Z5U6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR53Q7Z5U6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR53Q7Z5U6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR53Q7Z5U6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR53Q7Z5U6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR53Q7Z5U6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR53Q7Z5U6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR53Q7Z5U6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR53Q7Z5U6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR53Q7Z5U6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR53Q7Z5U6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR53Q7Z5U6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR53Q7Z5U6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR53Q7Z5U6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR53Q7Z5U6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR53Q7Z5U6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR53Q7Z5U6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR53Q7Z5U6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR53Q7Z5U6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR53Q7Z5U6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR53Q7Z5U6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR53Q7Z5U6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR53Q7Z5U6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR53Q7Z5U6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR53Q7Z5U6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR53Q7Z5U6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR53Q7Z5U6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR53Q7Z5U6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WDR53Q7Z5U6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WDR53Q7Z5U6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR53Q7Z5U6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR53Q7Z5U6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR53Q7Z5U6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR53Q7Z5U6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR53Q7Z5U6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR53Q7Z5U6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR53Q7Z5U6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR53Q7Z5U6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR53Q7Z5U6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR53Q7Z5U6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR53Q7Z5U6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR53Q7Z5U6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR53Q7Z5U6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR53Q7Z5U6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR53Q7Z5U6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR53Q7Z5U6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR53Q7Z5U6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR53Q7Z5U6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR53Q7Z5U6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR53Q7Z5U6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR53Q7Z5U6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR53Q7Z5U6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.7 ms