Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN12Q6ZSI9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN12Q6ZSI9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN12Q6ZSI9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN12Q6ZSI9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN12Q6ZSI9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN12Q6ZSI9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN12Q6ZSI9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPN12Q6ZSI9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPN12Q6ZSI9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPN12Q6ZSI9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPN12Q6ZSI9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPN12Q6ZSI9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPN12Q6ZSI9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN12Q6ZSI9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN12Q6ZSI9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN12Q6ZSI9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN12Q6ZSI9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN12Q6ZSI9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN12Q6ZSI9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPN12Q6ZSI9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPN12Q6ZSI9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPN12Q6ZSI9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPN12Q6ZSI9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPN12Q6ZSI9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPN12Q6ZSI9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPN12Q6ZSI9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPN12Q6ZSI9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPN12Q6ZSI9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPN12Q6ZSI9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPN12Q6ZSI9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN12Q6ZSI9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN12Q6ZSI9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN12Q6ZSI9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN12Q6ZSI9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN12Q6ZSI9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN12Q6ZSI9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN12Q6ZSI9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN12Q6ZSI9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN12Q6ZSI9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPN12Q6ZSI9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPN12Q6ZSI9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPN12Q6ZSI9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPN12Q6ZSI9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPN12Q6ZSI9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CAPN12Q6ZSI9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPN12Q6ZSI9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPN12Q6ZSI9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN12Q6ZSI9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN12Q6ZSI9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN12Q6ZSI9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN12Q6ZSI9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN12Q6ZSI9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN12Q6ZSI9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN12Q6ZSI9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN12Q6ZSI9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN12Q6ZSI9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN12Q6ZSI9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN12Q6ZSI9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN12Q6ZSI9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN12Q6ZSI9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN12Q6ZSI9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN12Q6ZSI9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN12Q6ZSI9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN12Q6ZSI9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN12Q6ZSI9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN12Q6ZSI9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN12Q6ZSI9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN12Q6ZSI9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms