Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RBM43Q6ZSC3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBM43Q6ZSC3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM43Q6ZSC3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM43Q6ZSC3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RBM43Q6ZSC3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RBM43Q6ZSC3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RBM43Q6ZSC3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RBM43Q6ZSC3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RBM43Q6ZSC3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RBM43Q6ZSC3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RBM43Q6ZSC3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM43Q6ZSC3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM43Q6ZSC3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM43Q6ZSC3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM43Q6ZSC3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM43Q6ZSC3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM43Q6ZSC3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RBM43Q6ZSC3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RBM43Q6ZSC3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RBM43Q6ZSC3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RBM43Q6ZSC3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM43Q6ZSC3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM43Q6ZSC3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM43Q6ZSC3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RBM43Q6ZSC3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RBM43Q6ZSC3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RBM43Q6ZSC3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM43Q6ZSC3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM43Q6ZSC3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBM43Q6ZSC3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBM43Q6ZSC3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBM43Q6ZSC3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBM43Q6ZSC3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM43Q6ZSC3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM43Q6ZSC3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM43Q6ZSC3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM43Q6ZSC3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM43Q6ZSC3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM43Q6ZSC3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM43Q6ZSC3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM43Q6ZSC3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM43Q6ZSC3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBM43Q6ZSC3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBM43Q6ZSC3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBM43Q6ZSC3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBM43Q6ZSC3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RBM43Q6ZSC3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RBM43Q6ZSC3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM43Q6ZSC3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM43Q6ZSC3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM43Q6ZSC3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM43Q6ZSC3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM43Q6ZSC3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM43Q6ZSC3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM43Q6ZSC3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM43Q6ZSC3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM43Q6ZSC3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM43Q6ZSC3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM43Q6ZSC3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBM43Q6ZSC3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM43Q6ZSC3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM43Q6ZSC3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBM43Q6ZSC3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBM43Q6ZSC3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM43Q6ZSC3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM43Q6ZSC3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM43Q6ZSC3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM43Q6ZSC3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM43Q6ZSC3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM43Q6ZSC3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM43Q6ZSC3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBM43Q6ZSC3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBM43Q6ZSC3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBM43Q6ZSC3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RBM43Q6ZSC3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM43Q6ZSC3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM43Q6ZSC3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM43Q6ZSC3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM43Q6ZSC3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM43Q6ZSC3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RBM43Q6ZSC3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RBM43Q6ZSC3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RBM43Q6ZSC3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM43Q6ZSC3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM43Q6ZSC3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM43Q6ZSC3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM43Q6ZSC3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM43Q6ZSC3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM43Q6ZSC3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM43Q6ZSC3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM43Q6ZSC3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM43Q6ZSC3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM43Q6ZSC3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM43Q6ZSC3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM43Q6ZSC3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM43Q6ZSC3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RBM43Q6ZSC3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RBM43Q6ZSC3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RBM43Q6ZSC3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms