Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX46

ALKAL2, ALK and LTK ligand 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL2Q6UX46 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ALKAL2Q6UX46 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALKAL2Q6UX46 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALKAL2Q6UX46 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALKAL2Q6UX46 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALKAL2Q6UX46 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALKAL2Q6UX46 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALKAL2Q6UX46 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALKAL2Q6UX46 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALKAL2Q6UX46 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALKAL2Q6UX46 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALKAL2Q6UX46 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALKAL2Q6UX46 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALKAL2Q6UX46 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALKAL2Q6UX46 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALKAL2Q6UX46 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ALKAL2Q6UX46 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALKAL2Q6UX46 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALKAL2Q6UX46 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALKAL2Q6UX46 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALKAL2Q6UX46 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALKAL2Q6UX46 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALKAL2Q6UX46 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALKAL2Q6UX46 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALKAL2Q6UX46 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALKAL2Q6UX46 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALKAL2Q6UX46 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALKAL2Q6UX46 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALKAL2Q6UX46 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALKAL2Q6UX46 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ALKAL2Q6UX46 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALKAL2Q6UX46 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ALKAL2Q6UX46 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALKAL2Q6UX46 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALKAL2Q6UX46 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALKAL2Q6UX46 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALKAL2Q6UX46 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALKAL2Q6UX46 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALKAL2Q6UX46 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALKAL2Q6UX46 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALKAL2Q6UX46 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALKAL2Q6UX46 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ALKAL2Q6UX46 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ALKAL2Q6UX46 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALKAL2Q6UX46 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALKAL2Q6UX46 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALKAL2Q6UX46 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ALKAL2Q6UX46 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALKAL2Q6UX46 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALKAL2Q6UX46 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALKAL2Q6UX46 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALKAL2Q6UX46 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALKAL2Q6UX46 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALKAL2Q6UX46 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALKAL2Q6UX46 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALKAL2Q6UX46 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALKAL2Q6UX46 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALKAL2Q6UX46 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALKAL2Q6UX46 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALKAL2Q6UX46 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALKAL2Q6UX46 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALKAL2Q6UX46 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALKAL2Q6UX46 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALKAL2Q6UX46 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALKAL2Q6UX46 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALKAL2Q6UX46 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALKAL2Q6UX46 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALKAL2Q6UX46 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALKAL2Q6UX46 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms