Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM74A1Q5RGS3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM74A1Q5RGS3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM74A1Q5RGS3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM74A1Q5RGS3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM74A1Q5RGS3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM74A1Q5RGS3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM74A1Q5RGS3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM74A1Q5RGS3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM74A1Q5RGS3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM74A1Q5RGS3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM74A1Q5RGS3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM74A1Q5RGS3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM74A1Q5RGS3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM74A1Q5RGS3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM74A1Q5RGS3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM74A1Q5RGS3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM74A1Q5RGS3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM74A1Q5RGS3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM74A1Q5RGS3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM74A1Q5RGS3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM74A1Q5RGS3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM74A1Q5RGS3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM74A1Q5RGS3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM74A1Q5RGS3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM74A1Q5RGS3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM74A1Q5RGS3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM74A1Q5RGS3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM74A1Q5RGS3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM74A1Q5RGS3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM74A1Q5RGS3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM74A1Q5RGS3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM74A1Q5RGS3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM74A1Q5RGS3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM74A1Q5RGS3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM74A1Q5RGS3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM74A1Q5RGS3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM74A1Q5RGS3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM74A1Q5RGS3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM74A1Q5RGS3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM74A1Q5RGS3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM74A1Q5RGS3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM74A1Q5RGS3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM74A1Q5RGS3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM74A1Q5RGS3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM74A1Q5RGS3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM74A1Q5RGS3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM74A1Q5RGS3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM74A1Q5RGS3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM74A1Q5RGS3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAM74A1Q5RGS3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM74A1Q5RGS3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM74A1Q5RGS3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM74A1Q5RGS3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM74A1Q5RGS3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM74A1Q5RGS3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FAM74A1Q5RGS3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM74A1Q5RGS3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM74A1Q5RGS3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM74A1Q5RGS3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM74A1Q5RGS3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM74A1Q5RGS3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM74A1Q5RGS3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM74A1Q5RGS3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM74A1Q5RGS3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms