Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAN3Q58A45 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAN3Q58A45 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAN3Q58A45 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAN3Q58A45 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAN3Q58A45 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAN3Q58A45 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PAN3Q58A45 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PAN3Q58A45 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAN3Q58A45 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAN3Q58A45 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAN3Q58A45 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAN3Q58A45 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAN3Q58A45 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAN3Q58A45 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAN3Q58A45 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAN3Q58A45 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAN3Q58A45 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAN3Q58A45 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAN3Q58A45 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAN3Q58A45 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAN3Q58A45 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PAN3Q58A45 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAN3Q58A45 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAN3Q58A45 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAN3Q58A45 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PAN3Q58A45 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAN3Q58A45 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAN3Q58A45 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAN3Q58A45 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAN3Q58A45 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAN3Q58A45 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAN3Q58A45 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAN3Q58A45 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAN3Q58A45 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAN3Q58A45 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAN3Q58A45 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAN3Q58A45 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAN3Q58A45 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAN3Q58A45 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAN3Q58A45 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAN3Q58A45 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms