Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWA3BQ502W6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWA3BQ502W6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWA3BQ502W6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VWA3BQ502W6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VWA3BQ502W6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWA3BQ502W6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWA3BQ502W6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWA3BQ502W6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWA3BQ502W6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VWA3BQ502W6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VWA3BQ502W6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
VWA3BQ502W6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWA3BQ502W6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWA3BQ502W6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWA3BQ502W6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWA3BQ502W6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWA3BQ502W6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
VWA3BQ502W6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWA3BQ502W6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWA3BQ502W6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
VWA3BQ502W6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VWA3BQ502W6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VWA3BQ502W6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VWA3BQ502W6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
VWA3BQ502W6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VWA3BQ502W6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VWA3BQ502W6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VWA3BQ502W6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VWA3BQ502W6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VWA3BQ502W6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VWA3BQ502W6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWA3BQ502W6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWA3BQ502W6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWA3BQ502W6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWA3BQ502W6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWA3BQ502W6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWA3BQ502W6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWA3BQ502W6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWA3BQ502W6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VWA3BQ502W6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VWA3BQ502W6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VWA3BQ502W6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VWA3BQ502W6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VWA3BQ502W6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VWA3BQ502W6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VWA3BQ502W6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VWA3BQ502W6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VWA3BQ502W6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VWA3BQ502W6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VWA3BQ502W6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VWA3BQ502W6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VWA3BQ502W6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VWA3BQ502W6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
VWA3BQ502W6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VWA3BQ502W6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VWA3BQ502W6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VWA3BQ502W6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VWA3BQ502W6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VWA3BQ502W6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VWA3BQ502W6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VWA3BQ502W6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWA3BQ502W6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWA3BQ502W6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWA3BQ502W6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VWA3BQ502W6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VWA3BQ502W6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VWA3BQ502W6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VWA3BQ502W6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWA3BQ502W6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWA3BQ502W6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWA3BQ502W6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWA3BQ502W6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWA3BQ502W6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VWA3BQ502W6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VWA3BQ502W6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VWA3BQ502W6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VWA3BQ502W6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VWA3BQ502W6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VWA3BQ502W6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWA3BQ502W6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWA3BQ502W6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWA3BQ502W6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWA3BQ502W6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWA3BQ502W6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms