Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGN3Q15651 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGN3Q15651 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGN3Q15651 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGN3Q15651 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGN3Q15651 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGN3Q15651 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGN3Q15651 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGN3Q15651 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGN3Q15651 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGN3Q15651 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGN3Q15651 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMGN3Q15651 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGN3Q15651 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMGN3Q15651 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGN3Q15651 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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