Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCLAFQ15004 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCLAFQ15004 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCLAFQ15004 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCLAFQ15004 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCLAFQ15004 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCLAFQ15004 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCLAFQ15004 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCLAFQ15004 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCLAFQ15004 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PCLAFQ15004 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCLAFQ15004 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCLAFQ15004 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PCLAFQ15004 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PCLAFQ15004 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCLAFQ15004 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCLAFQ15004 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCLAFQ15004 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCLAFQ15004 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCLAFQ15004 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCLAFQ15004 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCLAFQ15004 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCLAFQ15004 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCLAFQ15004 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCLAFQ15004 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCLAFQ15004 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCLAFQ15004 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCLAFQ15004 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCLAFQ15004 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCLAFQ15004 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCLAFQ15004 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCLAFQ15004 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCLAFQ15004 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCLAFQ15004 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PCLAFQ15004 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCLAFQ15004 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCLAFQ15004 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCLAFQ15004 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCLAFQ15004 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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