Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
BECN1Q14457 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
BECN1Q14457 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
BECN1Q14457 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
BECN1Q14457 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
BECN1Q14457 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
BECN1Q14457 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
BECN1Q14457 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
BECN1Q14457 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
BECN1Q14457 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
BECN1Q14457 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
BECN1Q14457 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
BECN1Q14457 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
BECN1Q14457 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
BECN1Q14457 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
BECN1Q14457 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
BECN1Q14457 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
BECN1Q14457 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
BECN1Q14457 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
BECN1Q14457 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
BECN1Q14457 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
BECN1Q14457 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
BECN1Q14457 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
BECN1Q14457 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
BECN1Q14457 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
BECN1Q14457 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
BECN1Q14457 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
BECN1Q14457 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
BECN1Q14457 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
BECN1Q14457 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
BECN1Q14457 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
BECN1Q14457 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
BECN1Q14457 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
BECN1Q14457 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
BECN1Q14457 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
BECN1Q14457 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
BECN1Q14457 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
BECN1Q14457 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
BECN1Q14457 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
BECN1Q14457 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
BECN1Q14457 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
BECN1Q14457 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
BECN1Q14457 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
BECN1Q14457 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
BECN1Q14457 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
BECN1Q14457 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
BECN1Q14457 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
BECN1Q14457 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
BECN1Q14457 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
BECN1Q14457 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
BECN1Q14457 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
BECN1Q14457 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
BECN1Q14457 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
BECN1Q14457 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
BECN1Q14457 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BECN1Q14457 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BECN1Q14457 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BECN1Q14457 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
BECN1Q14457 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
BECN1Q14457 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
BECN1Q14457 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
BECN1Q14457 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
BECN1Q14457 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
BECN1Q14457 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
BECN1Q14457 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
BECN1Q14457 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
BECN1Q14457 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
BECN1Q14457 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
BECN1Q14457 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
BECN1Q14457 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
BECN1Q14457 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
BECN1Q14457 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BECN1Q14457 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
BECN1Q14457 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
BECN1Q14457 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BECN1Q14457 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BECN1Q14457 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
BECN1Q14457 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
BECN1Q14457 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BECN1Q14457 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BECN1Q14457 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BECN1Q14457 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BECN1Q14457 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
BECN1Q14457 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BECN1Q14457 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BECN1Q14457 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BECN1Q14457 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
BECN1Q14457 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
BECN1Q14457 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
BECN1Q14457 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
BECN1Q14457 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
BECN1Q14457 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
BECN1Q14457 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
BECN1Q14457 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
BECN1Q14457 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
BECN1Q14457 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
BECN1Q14457 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
BECN1Q14457 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
BECN1Q14457 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
BECN1Q14457 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
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