Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 RNASEH2B-204ENST00000465541 498 ntTSL 55.4□□□□□ -1.542e-7■■■■■ 64.2
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PABPC4Q13310 C11orf1-201ENST00000260276 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.132e-9■■■■■ 64.1
PABPC4Q13310 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.062e-9■■■■■ 64.1
PABPC4Q13310 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.632e-9■■■■■ 64.1
PABPC4Q13310 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.236e-9■■■■■ 63.9
PABPC4Q13310 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.236e-9■■■■■ 63.9
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PABPC4Q13310 MRS2-204ENST00000443868 3980 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.541e-9■■■■■ 63.8
PABPC4Q13310 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.253e-10■■■■■ 63.8
PABPC4Q13310 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.281e-8■■■■■ 63.6
PABPC4Q13310 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.211e-8■■■■■ 63.6
PABPC4Q13310 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 63.6
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PABPC4Q13310 OPTN-204ENST00000378752 3488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 63.3
PABPC4Q13310 OPTN-202ENST00000378747 3400 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 63.3
PABPC4Q13310 OPTN-203ENST00000378748 3521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 63.3
PABPC4Q13310 OPTN-209ENST00000469025 642 ntTSL 36.89□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 63.3
PABPC4Q13310 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.936e-7■■■■■ 63.3
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PABPC4Q13310 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.732e-20■■■■■ 62.1
PABPC4Q13310 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.391e-17■■■■■ 62
PABPC4Q13310 RBSN-201ENST00000253699 6678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.642e-9■■■■■ 61.9
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PABPC4Q13310 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.469e-10■■■■■ 61.6
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PABPC4Q13310 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.939e-10■■■■■ 61.6
PABPC4Q13310 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.999e-10■■■■■ 61.6
PABPC4Q13310 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.441e-23■■■■■ 61.6
PABPC4Q13310 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.739e-8■■■■■ 61.5
PABPC4Q13310 NLN-201ENST00000380985 8661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.669e-8■■■■■ 61.5
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PABPC4Q13310 GALM-201ENST00000272252 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 61.4
PABPC4Q13310 GALM-204ENST00000434934 724 ntTSL 34.63□□□□□ -1.671e-7■■■■■ 61.4
PABPC4Q13310 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.424e-7■■■■■ 61.4
PABPC4Q13310 RNASE1-204ENST00000412779 896 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 61.4
PABPC4Q13310 RNASE1-201ENST00000340900 878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 61.4
PABPC4Q13310 RNASE1-203ENST00000397970 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 61.4
PABPC4Q13310 RNASE1-205ENST00000555698 655 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.694e-7■■■■■ 61.4
PABPC4Q13310 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.565e-19■■■■■ 61.4
PABPC4Q13310 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.492e-9■■■■■ 61.3
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PABPC4Q13310 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.222e-12■■■■■ 61.3
PABPC4Q13310 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.121e-20■■■■■ 61.1
PABPC4Q13310 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.182e-9■■■■■ 61
PABPC4Q13310 CBLL1-205ENST00000440859 4432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.494e-16■■■■■ 60.7
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PABPC4Q13310 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.414e-14■■■■■ 60.7
PABPC4Q13310 ZNF131-218ENST00000511736 956 ntTSL 1 (best)16.71■□□□□ 0.274e-14■■■■■ 60.7
PABPC4Q13310 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.274e-14■■■■■ 60.7
PABPC4Q13310 ZNF131-216ENST00000510026 2599 ntTSL 512.91□□□□□ -0.344e-14■■■■■ 60.7
PABPC4Q13310 EXTL2-202ENST00000370114 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.534e-14■■■■■ 60.7
PABPC4Q13310 ZNF131-203ENST00000502623 760 ntTSL 36.92□□□□□ -1.34e-14■■■■■ 60.7
PABPC4Q13310 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.344e-14■■■■■ 60.7
PABPC4Q13310 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.364e-14■■■■■ 60.7
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PABPC4Q13310 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.945e-10■■■■■ 60.6
PABPC4Q13310 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.625e-10■■■■■ 60.6
PABPC4Q13310 VEGFA-215ENST00000497139 2746 ntTSL 1 (best)13.89□□□□□ -0.195e-10■■■■■ 60.6
PABPC4Q13310 VEGFA-212ENST00000480614 12167 ntTSL 1 (best)10.48□□□□□ -0.735e-10■■■■■ 60.6
PABPC4Q13310 NPM1-212ENST00000524204 640 ntTSL 26.26□□□□□ -1.411e-323■■■■■ 60.6
PABPC4Q13310 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.771e-6■■■■■ 60.5
PABPC4Q13310 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 60.5
PABPC4Q13310 MXI1-210ENST00000485566 2755 ntTSL 1 (best)9.47□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 60.5
PABPC4Q13310 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 60.5
PABPC4Q13310 MT1X-204ENST00000568370 1727 nt18.96■□□□□ 0.631e-8■■■■■ 60.4
PABPC4Q13310 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.11e-8■■■■■ 60.4
PABPC4Q13310 MT1X-201ENST00000394485 450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.581e-8■■■■■ 60.4
PABPC4Q13310 MT1X-203ENST00000564974 549 ntTSL 1 (best)11.04□□□□□ -0.641e-8■■■■■ 60.4
PABPC4Q13310 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.11e-20■■■■■ 60.4
PABPC4Q13310 RPL31-201ENST00000264258 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.551e-20■■■■■ 60.4
PABPC4Q13310 RPL31-203ENST00000409028 1110 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.91e-20■■■■■ 60.4
PABPC4Q13310 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.291e-20■■■■■ 60.4
PABPC4Q13310 RPL31-209ENST00000419276 781 ntTSL 56.89□□□□□ -1.311e-20■■■■■ 60.4
PABPC4Q13310 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.491e-20■■■■■ 60.4
PABPC4Q13310 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.51e-20■■■■■ 60.4
PABPC4Q13310 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.122e-30■■■■■ 60
PABPC4Q13310 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.952e-30■■■■■ 60
PABPC4Q13310 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.042e-30■■■■■ 60
PABPC4Q13310 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.767e-12■■■■■ 59.9
PABPC4Q13310 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.077e-12■■■■■ 59.9
PABPC4Q13310 KDM4C-202ENST00000381309 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.758e-10■■■■■ 59.8
PABPC4Q13310 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.129e-18■■■■■ 59.7
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 305.9 ms