Protein–RNA interactions for Protein: Q13277

STX3, Syntaxin-3, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX3Q13277 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STX3Q13277 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STX3Q13277 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STX3Q13277 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX3Q13277 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX3Q13277 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX3Q13277 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX3Q13277 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX3Q13277 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX3Q13277 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX3Q13277 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX3Q13277 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX3Q13277 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX3Q13277 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX3Q13277 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STX3Q13277 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STX3Q13277 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STX3Q13277 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX3Q13277 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX3Q13277 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX3Q13277 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX3Q13277 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX3Q13277 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX3Q13277 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX3Q13277 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX3Q13277 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
STX3Q13277 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX3Q13277 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX3Q13277 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX3Q13277 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX3Q13277 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX3Q13277 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX3Q13277 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
STX3Q13277 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
STX3Q13277 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX3Q13277 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX3Q13277 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX3Q13277 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX3Q13277 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX3Q13277 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX3Q13277 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX3Q13277 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX3Q13277 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX3Q13277 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX3Q13277 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX3Q13277 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX3Q13277 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX3Q13277 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX3Q13277 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX3Q13277 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX3Q13277 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
STX3Q13277 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX3Q13277 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX3Q13277 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX3Q13277 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX3Q13277 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX3Q13277 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX3Q13277 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STX3Q13277 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX3Q13277 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX3Q13277 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX3Q13277 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX3Q13277 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX3Q13277 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX3Q13277 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX3Q13277 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX3Q13277 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX3Q13277 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX3Q13277 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX3Q13277 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX3Q13277 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STX3Q13277 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STX3Q13277 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STX3Q13277 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STX3Q13277 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STX3Q13277 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STX3Q13277 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX3Q13277 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX3Q13277 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX3Q13277 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX3Q13277 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX3Q13277 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX3Q13277 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX3Q13277 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX3Q13277 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX3Q13277 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX3Q13277 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX3Q13277 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX3Q13277 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX3Q13277 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX3Q13277 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX3Q13277 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX3Q13277 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX3Q13277 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX3Q13277 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX3Q13277 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX3Q13277 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX3Q13277 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX3Q13277 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX3Q13277 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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