Protein–RNA interactions for Protein: Q12527

ATG11, Autophagy-related protein 11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG11Q12527 NPP1YCR026C 2229 nt9.14□□□□□ -0.95
ATG11Q12527 SFP1YLR403W 2052 nt9.13□□□□□ -0.95
ATG11Q12527 EMC3YKL207W 762 nt9.13□□□□□ -0.95
ATG11Q12527 YPL108WYPL108W 507 nt9.12□□□□□ -0.95
ATG11Q12527 YJL160CYJL160C 864 nt9.11□□□□□ -0.95
ATG11Q12527 SWT21YNL187W 1074 nt9.11□□□□□ -0.95
ATG11Q12527 ELO1YJL196C 933 nt9.1□□□□□ -0.95
ATG11Q12527 KEL3YPL263C 1956 nt9.1□□□□□ -0.95
ATG11Q12527 SFL1YOR140W 2301 nt9.09□□□□□ -0.95
ATG11Q12527 YLR046CYLR046C 813 nt9.09□□□□□ -0.95
ATG11Q12527 REX2YLR059C 810 nt9.09□□□□□ -0.95
ATG11Q12527 MFG1YDL233W 1377 nt9.09□□□□□ -0.95
ATG11Q12527 MRP1YDR347W 966 nt9.08□□□□□ -0.96
ATG11Q12527 YMR210WYMR210W 1350 nt9.07□□□□□ -0.96
ATG11Q12527 PSD1YNL169C 1503 nt9.06□□□□□ -0.96
ATG11Q12527 MET1YKR069W 1782 nt9.04□□□□□ -0.96
ATG11Q12527 EDC2YER035W 438 nt9.04□□□□□ -0.96
ATG11Q12527 CYT1YOR065W 930 nt9.04□□□□□ -0.96
ATG11Q12527 RIM2YBR192W 1134 nt9.04□□□□□ -0.96
ATG11Q12527 BSP1YPR171W 1731 nt9.04□□□□□ -0.96
ATG11Q12527 ESBP6YNL125C 2022 nt9.03□□□□□ -0.96
ATG11Q12527 SRP54YPR088C 1626 nt9.02□□□□□ -0.96
ATG11Q12527 YKL053WYKL053W 375 nt9.02□□□□□ -0.97
ATG11Q12527 SUV3YPL029W 2214 nt9.02□□□□□ -0.97
ATG11Q12527 YFR020WYFR020W 699 nt9.01□□□□□ -0.97
ATG11Q12527 ZAP1YJL056C 2643 nt9.01□□□□□ -0.97
ATG11Q12527 ITR2YOL103W 1830 nt9.01□□□□□ -0.97
ATG11Q12527 DMA2YNL116W 1569 nt9□□□□□ -0.97
ATG11Q12527 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt9□□□□□ -0.97
ATG11Q12527 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt9□□□□□ -0.97
ATG11Q12527 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt9□□□□□ -0.97
ATG11Q12527 SUP51tL(UAA)J 84 nt9□□□□□ -0.97
ATG11Q12527 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt9□□□□□ -0.97
ATG11Q12527 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt9□□□□□ -0.97
ATG11Q12527 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt9□□□□□ -0.97
ATG11Q12527 KAE1YKR038C 1161 nt8.99□□□□□ -0.97
ATG11Q12527 snR31snR31 225 nt8.99□□□□□ -0.97
ATG11Q12527 GDH1YOR375C 1365 nt8.99□□□□□ -0.97
ATG11Q12527 LSP1YPL004C 1026 nt8.97□□□□□ -0.97
ATG11Q12527 DLD3YEL071W 1491 nt8.96□□□□□ -0.97
ATG11Q12527 PET18YCR020C 648 nt8.96□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 YMR206WYMR206W 942 nt8.96□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 HAP5YOR358W 729 nt8.96□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 HOG1YLR113W 1308 nt8.96□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 GID8YMR135C 1368 nt8.96□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 YPT11YNL304W 1254 nt8.95□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 YMR265CYMR265C 1386 nt8.95□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 YHL008CYHL008C 1884 nt8.94□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 CSM2YIL132C 642 nt8.94□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 YMR166CYMR166C 1107 nt8.94□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 CRC1YOR100C 984 nt8.94□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 ODC1YPL134C 933 nt8.94□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 ADA2YDR448W 1305 nt8.94□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 SAN1YDR143C 1833 nt8.94□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 HMG2YLR450W 3138 nt8.94□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 TOS1YBR162C 1368 nt8.92□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 MET8YBR213W 825 nt8.92□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 UTR5YEL035C 501 nt8.91□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 RPN14YGL004C 1254 nt8.91□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 ILV2YMR108W 2064 nt8.9□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 TPO4YOR273C 1980 nt8.9□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 YKL133CYKL133C 1392 nt8.9□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 TAD2YJL035C 753 nt8.9□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 MFT1YML062C 1179 nt8.9□□□□□ -0.98
ATG11Q12527 MRS6YOR370C 1812 nt8.89□□□□□ -0.99
ATG11Q12527 Q0010Q0010 387 nt8.89□□□□□ -0.99
ATG11Q12527 SSL2YIL143C 2532 nt8.87□□□□□ -0.99
ATG11Q12527 RRT14YIL127C 621 nt8.87□□□□□ -0.99
ATG11Q12527 RSM7YJR113C 744 nt8.87□□□□□ -0.99
ATG11Q12527 YJR149WYJR149W 1215 nt8.87□□□□□ -0.99
ATG11Q12527 VMA11YPL234C 495 nt8.87□□□□□ -0.99
ATG11Q12527 DTR1YBR180W 1719 nt8.86□□□□□ -0.99
ATG11Q12527 YHR218WYHR218W 1812 nt8.86□□□□□ -0.99
ATG11Q12527 ELP4YPL101W 1371 nt8.86□□□□□ -0.99
ATG11Q12527 BAP3YDR046C 1815 nt8.85□□□□□ -0.99
ATG11Q12527 YER156CYER156C 1017 nt8.85□□□□□ -0.99
ATG11Q12527 YHR219WYHR219W 1875 nt8.85□□□□□ -0.99
ATG11Q12527 KGD2YDR148C 1392 nt8.85□□□□□ -0.99
ATG11Q12527 CAK1YFL029C 1107 nt8.84□□□□□ -0.99
ATG11Q12527 GAS1YMR307W 1680 nt8.84□□□□□ -0.99
ATG11Q12527 PTC6YCR079W 1329 nt8.83□□□□□ -1
ATG11Q12527 MDM35YKL053C-A 261 nt8.83□□□□□ -1
ATG11Q12527 PRE5YMR314W 705 nt8.83□□□□□ -1
ATG11Q12527 LSR1LSR1 1175 nt8.83□□□□□ -1
ATG11Q12527 SDH8YBR269C 417 nt8.83□□□□□ -1
ATG11Q12527 RFC1YOR217W 2586 nt8.82□□□□□ -1
ATG11Q12527 YJR154WYJR154W 1041 nt8.82□□□□□ -1
ATG11Q12527 YRF1-2YER190W 5046 nt8.82□□□□□ -1
ATG11Q12527 ADE1YAR015W 921 nt8.81□□□□□ -1
ATG11Q12527 SNX3YOR357C 489 nt8.81□□□□□ -1
ATG11Q12527 YPL247CYPL247C 1572 nt8.8□□□□□ -1
ATG11Q12527 YLR460CYLR460C 1131 nt8.79□□□□□ -1
ATG11Q12527 OCH1YGL038C 1443 nt8.79□□□□□ -1
ATG11Q12527 SBP1YHL034C 885 nt8.78□□□□□ -1
ATG11Q12527 CWP2YKL096W-A 279 nt8.78□□□□□ -1
ATG11Q12527 FUS3YBL016W 1062 nt8.78□□□□□ -1
ATG11Q12527 HXT10YFL011W 1641 nt8.77□□□□□ -1.01
ATG11Q12527 YJL043WYJL043W 774 nt8.77□□□□□ -1.01
ATG11Q12527 GTB1YDR221W 2109 nt8.76□□□□□ -1.01
ATG11Q12527 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.8 ms