Protein–RNA interactions for Protein: Q12093

SLM3, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3Q12093 YFR020WYFR020W 699 nt10.73□□□□□ -0.69
SLM3Q12093 SDH8YBR269C 417 nt10.73□□□□□ -0.69
SLM3Q12093 YOR325WYOR325W 474 nt10.72□□□□□ -0.69
SLM3Q12093 BAP3YDR046C 1815 nt10.71□□□□□ -0.69
SLM3Q12093 ADA2YDR448W 1305 nt10.71□□□□□ -0.69
SLM3Q12093 PRE5YMR314W 705 nt10.69□□□□□ -0.7
SLM3Q12093 ITR2YOL103W 1830 nt10.69□□□□□ -0.7
SLM3Q12093 SUV3YPL029W 2214 nt10.69□□□□□ -0.7
SLM3Q12093 YPL247CYPL247C 1572 nt10.69□□□□□ -0.7
SLM3Q12093 NAR1YNL240C 1476 nt10.68□□□□□ -0.7
SLM3Q12093 YJR149WYJR149W 1215 nt10.67□□□□□ -0.7
SLM3Q12093 YMR166CYMR166C 1107 nt10.67□□□□□ -0.7
SLM3Q12093 INA1YLR413W 2028 nt10.66□□□□□ -0.7
SLM3Q12093 YAT1YAR035W 2064 nt10.65□□□□□ -0.7
SLM3Q12093 MFT1YML062C 1179 nt10.65□□□□□ -0.7
SLM3Q12093 snR31snR31 225 nt10.65□□□□□ -0.7
SLM3Q12093 TAD2YJL035C 753 nt10.64□□□□□ -0.71
SLM3Q12093 ELP4YPL101W 1371 nt10.64□□□□□ -0.71
SLM3Q12093 OPI10YOL032W 741 nt10.63□□□□□ -0.71
SLM3Q12093 CRC1YOR100C 984 nt10.63□□□□□ -0.71
SLM3Q12093 YPT11YNL304W 1254 nt10.62□□□□□ -0.71
SLM3Q12093 HAP5YOR358W 729 nt10.61□□□□□ -0.71
SLM3Q12093 SAN1YDR143C 1833 nt10.61□□□□□ -0.71
SLM3Q12093 DLD3YEL071W 1491 nt10.6□□□□□ -0.71
SLM3Q12093 YMR265CYMR265C 1386 nt10.59□□□□□ -0.71
SLM3Q12093 RPC82YPR190C 1965 nt10.58□□□□□ -0.72
SLM3Q12093 ILV3YJR016C 1758 nt10.58□□□□□ -0.72
SLM3Q12093 ADE1YAR015W 921 nt10.57□□□□□ -0.72
SLM3Q12093 CAK1YFL029C 1107 nt10.56□□□□□ -0.72
SLM3Q12093 RRT14YIL127C 621 nt10.56□□□□□ -0.72
SLM3Q12093 RSM7YJR113C 744 nt10.56□□□□□ -0.72
SLM3Q12093 YJL043WYJL043W 774 nt10.55□□□□□ -0.72
SLM3Q12093 PET494YNR045W 1470 nt10.55□□□□□ -0.72
SLM3Q12093 RPN14YGL004C 1254 nt10.54□□□□□ -0.72
SLM3Q12093 YER156CYER156C 1017 nt10.53□□□□□ -0.72
SLM3Q12093 PTC6YCR079W 1329 nt10.53□□□□□ -0.72
SLM3Q12093 FUS3YBL016W 1062 nt10.52□□□□□ -0.73
SLM3Q12093 KGD2YDR148C 1392 nt10.52□□□□□ -0.73
SLM3Q12093 RPS6AYPL090C 711 nt10.51□□□□□ -0.73
SLM3Q12093 RPS6BYBR181C 711 nt10.51□□□□□ -0.73
SLM3Q12093 LSR1LSR1 1175 nt10.5□□□□□ -0.73
SLM3Q12093 GAS1YMR307W 1680 nt10.5□□□□□ -0.73
SLM3Q12093 VMA11YPL234C 495 nt10.48□□□□□ -0.73
SLM3Q12093 OCH1YGL038C 1443 nt10.48□□□□□ -0.73
SLM3Q12093 BXI1YNL305C 894 nt10.47□□□□□ -0.73
SLM3Q12093 GID8YMR135C 1368 nt10.47□□□□□ -0.73
SLM3Q12093 YHR219WYHR219W 1875 nt10.47□□□□□ -0.73
SLM3Q12093 YLR460CYLR460C 1131 nt10.46□□□□□ -0.73
SLM3Q12093 YPR084WYPR084W 1371 nt10.46□□□□□ -0.74
SLM3Q12093 TDH1YJL052W 999 nt10.45□□□□□ -0.74
SLM3Q12093 ARO8YGL202W 1503 nt10.44□□□□□ -0.74
SLM3Q12093 SNX3YOR357C 489 nt10.44□□□□□ -0.74
SLM3Q12093 MET22YOL064C 1074 nt10.43□□□□□ -0.74
SLM3Q12093 NUP53YMR153W 1428 nt10.42□□□□□ -0.74
SLM3Q12093 SBP1YHL034C 885 nt10.42□□□□□ -0.74
SLM3Q12093 COS10YNR075W 1125 nt10.4□□□□□ -0.74
SLM3Q12093 MUP1YGR055W 1725 nt10.4□□□□□ -0.74
SLM3Q12093 MRS6YOR370C 1812 nt10.4□□□□□ -0.75
SLM3Q12093 YKL133CYKL133C 1392 nt10.39□□□□□ -0.75
SLM3Q12093 CHS7YHR142W 951 nt10.39□□□□□ -0.75
SLM3Q12093 RPR1RPR1 369 nt10.37□□□□□ -0.75
SLM3Q12093 KES1YPL145C 1305 nt10.36□□□□□ -0.75
SLM3Q12093 ATP2YJR121W 1536 nt10.35□□□□□ -0.75
SLM3Q12093 YIL168WYIL168W 384 nt10.35□□□□□ -0.75
SLM3Q12093 OLA1YBR025C 1185 nt10.34□□□□□ -0.75
SLM3Q12093 PDC6YGR087C 1692 nt10.34□□□□□ -0.75
SLM3Q12093 Q0182Q0182 405 nt10.33□□□□□ -0.76
SLM3Q12093 RPD3YNL330C 1302 nt10.32□□□□□ -0.76
SLM3Q12093 SPT20YOL148C 1815 nt10.3□□□□□ -0.76
SLM3Q12093 NVJ2YPR091C 2313 nt10.3□□□□□ -0.76
SLM3Q12093 YPT31YER031C 672 nt10.3□□□□□ -0.76
SLM3Q12093 RRT6YGL146C 936 nt10.3□□□□□ -0.76
SLM3Q12093 RNA170RNA170 169 nt10.3□□□□□ -0.76
SLM3Q12093 COQ8YGL119W 1506 nt10.29□□□□□ -0.76
SLM3Q12093 YBL095WYBL095W 813 nt10.28□□□□□ -0.76
SLM3Q12093 YDR476CYDR476C 675 nt10.27□□□□□ -0.77
SLM3Q12093 YLR358CYLR358C 564 nt10.27□□□□□ -0.77
SLM3Q12093 SGA1YIL099W 1650 nt10.25□□□□□ -0.77
SLM3Q12093 YML079WYML079W 606 nt10.25□□□□□ -0.77
SLM3Q12093 MCH5YOR306C 1566 nt10.22□□□□□ -0.77
SLM3Q12093 RHO1YPR165W 630 nt10.21□□□□□ -0.77
SLM3Q12093 HAC1YFL031W 717 nt10.2□□□□□ -0.78
SLM3Q12093 PUP2YGR253C 783 nt10.2□□□□□ -0.78
SLM3Q12093 THI73YLR004C 1572 nt10.18□□□□□ -0.78
SLM3Q12093 ZAP1YJL056C 2643 nt10.18□□□□□ -0.78
SLM3Q12093 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt10.18□□□□□ -0.78
SLM3Q12093 THI3YDL080C 1830 nt10.18□□□□□ -0.78
SLM3Q12093 GGA2YHR108W 1758 nt10.18□□□□□ -0.78
SLM3Q12093 PSP2YML017W 1782 nt10.17□□□□□ -0.78
SLM3Q12093 HOL1YNR055C 1761 nt10.16□□□□□ -0.78
SLM3Q12093 RPC31YNL151C 756 nt10.16□□□□□ -0.78
SLM3Q12093 NCA3YJL116C 1014 nt10.14□□□□□ -0.79
SLM3Q12093 URA1YKL216W 945 nt10.14□□□□□ -0.79
SLM3Q12093 SHC1YER096W 1539 nt10.13□□□□□ -0.79
SLM3Q12093 YIR035CYIR035C 765 nt10.12□□□□□ -0.79
SLM3Q12093 DPL1YDR294C 1770 nt10.11□□□□□ -0.79
SLM3Q12093 KRR1YCL059C 951 nt10.1□□□□□ -0.79
SLM3Q12093 DOC1YGL240W 753 nt10.1□□□□□ -0.79
SLM3Q12093 JHD1YER051W 1479 nt10.1□□□□□ -0.79
SLM3Q12093 GPM1YKL152C 744 nt10.08□□□□□ -0.8
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