Protein–RNA interactions for Protein: Q04603

DPB4, DNA polymerase epsilon subunit D, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DPB4Q04603 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.38□□□□□ -1.23
DPB4Q04603 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.38□□□□□ -1.23
DPB4Q04603 LSR1LSR1 1175 nt7.38□□□□□ -1.23
DPB4Q04603 ITR2YOL103W 1830 nt7.38□□□□□ -1.23
DPB4Q04603 NDE1YMR145C 1683 nt7.38□□□□□ -1.23
DPB4Q04603 HAL5YJL165C 2568 nt7.37□□□□□ -1.23
DPB4Q04603 TIM44YIL022W 1296 nt7.37□□□□□ -1.23
DPB4Q04603 SAC7YDR389W 1965 nt7.37□□□□□ -1.23
DPB4Q04603 CRN1YLR429W 1956 nt7.37□□□□□ -1.23
DPB4Q04603 KRR1YCL059C 951 nt7.36□□□□□ -1.23
DPB4Q04603 DPH5YLR172C 903 nt7.36□□□□□ -1.23
DPB4Q04603 TIP1YBR067C 633 nt7.36□□□□□ -1.23
DPB4Q04603 SMC5YOL034W 3282 nt7.35□□□□□ -1.23
DPB4Q04603 ADE8YDR408C 645 nt7.35□□□□□ -1.23
DPB4Q04603 SGV1YPR161C 1974 nt7.33□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 POP2YNR052C 1302 nt7.33□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 AGP3YFL055W 1677 nt7.33□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 YJR114WYJR114W 393 nt7.33□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 YMR262WYMR262W 942 nt7.33□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 YNR064CYNR064C 873 nt7.33□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 YPL041CYPL041C 624 nt7.33□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 DUS3YLR401C 2007 nt7.33□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 GGC1YDL198C 903 nt7.32□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 CCT5YJR064W 1689 nt7.32□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 SNX3YOR357C 489 nt7.31□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 YPR126CYPR126C 309 nt7.31□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 CMK2YOL016C 1344 nt7.3□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 HDA1YNL021W 2121 nt7.3□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 YJL195CYJL195C 702 nt7.3□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 RPC31YNL151C 756 nt7.3□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 YOR300WYOR300W 309 nt7.3□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 YEN1YER041W 2280 nt7.3□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 RPN14YGL004C 1254 nt7.29□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 CIR2YOR356W 1896 nt7.29□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 YMR265CYMR265C 1386 nt7.29□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 SNZ1YMR096W 894 nt7.28□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 IML3YBR107C 738 nt7.28□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 BEM1YBR200W 1656 nt7.28□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 ADE16YLR028C 1776 nt7.28□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 KEL3YPL263C 1956 nt7.28□□□□□ -1.24
DPB4Q04603 TVP23YDR084C 600 nt7.27□□□□□ -1.25
DPB4Q04603 ELO1YJL196C 933 nt7.27□□□□□ -1.25
DPB4Q04603 HAP5YOR358W 729 nt7.27□□□□□ -1.25
DPB4Q04603 RIM2YBR192W 1134 nt7.27□□□□□ -1.25
DPB4Q04603 CTF3YLR381W 2202 nt7.27□□□□□ -1.25
DPB4Q04603 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.26□□□□□ -1.25
DPB4Q04603 OPI3YJR073C 621 nt7.26□□□□□ -1.25
DPB4Q04603 CCR4YAL021C 2514 nt7.26□□□□□ -1.25
DPB4Q04603 SPS100YHR139C 981 nt7.25□□□□□ -1.25
DPB4Q04603 CTI6YPL181W 1521 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB4Q04603 FUN14YAL008W 597 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB4Q04603 AIM34YMR003W 597 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB4Q04603 snR31snR31 225 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB4Q04603 SUV3YPL029W 2214 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB4Q04603 TOP3YLR234W 1971 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB4Q04603 AFG2YLR397C 2343 nt7.23□□□□□ -1.25
DPB4Q04603 DPL1YDR294C 1770 nt7.23□□□□□ -1.25
DPB4Q04603 HEL1YKR017C 1656 nt7.22□□□□□ -1.25
DPB4Q04603 INH1YDL181W 258 nt7.22□□□□□ -1.25
DPB4Q04603 YEL008WYEL008W 381 nt7.22□□□□□ -1.25
DPB4Q04603 YHC3YJL059W 1227 nt7.22□□□□□ -1.25
DPB4Q04603 MHF1YOL086W-A 273 nt7.22□□□□□ -1.25
DPB4Q04603 BAP3YDR046C 1815 nt7.21□□□□□ -1.26
DPB4Q04603 ITR1YDR497C 1755 nt7.2□□□□□ -1.26
DPB4Q04603 YIL108WYIL108W 2091 nt7.2□□□□□ -1.26
DPB4Q04603 TAF13YML098W 504 nt7.2□□□□□ -1.26
DPB4Q04603 ABZ2YMR289W 1125 nt7.2□□□□□ -1.26
DPB4Q04603 ORT1YOR130C 879 nt7.2□□□□□ -1.26
DPB4Q04603 PFS2YNL317W 1398 nt7.2□□□□□ -1.26
DPB4Q04603 SWT21YNL187W 1074 nt7.19□□□□□ -1.26
DPB4Q04603 RBS1YDL189W 1374 nt7.18□□□□□ -1.26
DPB4Q04603 FET5YFL041W 1869 nt7.17□□□□□ -1.26
DPB4Q04603 LEU4YNL104C 1860 nt7.17□□□□□ -1.26
DPB4Q04603 AMF1YOR378W 1548 nt7.17□□□□□ -1.26
DPB4Q04603 CRC1YOR100C 984 nt7.17□□□□□ -1.26
DPB4Q04603 YDR467CYDR467C 327 nt7.16□□□□□ -1.26
DPB4Q04603 POT1YIL160C 1254 nt7.16□□□□□ -1.26
DPB4Q04603 ENO2YHR174W 1314 nt7.16□□□□□ -1.26
DPB4Q04603 CKI1YLR133W 1749 nt7.15□□□□□ -1.26
DPB4Q04603 ASN2YGR124W 1719 nt7.14□□□□□ -1.27
DPB4Q04603 YGR139WYGR139W 339 nt7.14□□□□□ -1.27
DPB4Q04603 YOS9YDR057W 1629 nt7.13□□□□□ -1.27
DPB4Q04603 COG1YGL223C 1254 nt7.13□□□□□ -1.27
DPB4Q04603 HXT13YEL069C 1695 nt7.12□□□□□ -1.27
DPB4Q04603 SLM3YDL033C 1254 nt7.11□□□□□ -1.27
DPB4Q04603 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.11□□□□□ -1.27
DPB4Q04603 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.11□□□□□ -1.27
DPB4Q04603 ATP10YLR393W 840 nt7.11□□□□□ -1.27
DPB4Q04603 snR4snR4 186 nt7.11□□□□□ -1.27
DPB4Q04603 STE4YOR212W 1272 nt7.1□□□□□ -1.27
DPB4Q04603 GPA1YHR005C 1419 nt7.1□□□□□ -1.27
DPB4Q04603 KGD2YDR148C 1392 nt7.09□□□□□ -1.27
DPB4Q04603 MSB3YNL293W 1902 nt7.09□□□□□ -1.27
DPB4Q04603 CSM2YIL132C 642 nt7.09□□□□□ -1.27
DPB4Q04603 GPM1YKL152C 744 nt7.09□□□□□ -1.27
DPB4Q04603 LEU2YCL018W 1095 nt7.09□□□□□ -1.27
DPB4Q04603 GFA1YKL104C 2154 nt7.09□□□□□ -1.27
DPB4Q04603 HSV2YGR223C 1347 nt7.08□□□□□ -1.28
DPB4Q04603 EHD3YDR036C 1503 nt7.08□□□□□ -1.28
DPB4Q04603 GSF2YML048W 1212 nt7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 105.6 ms