Protein–RNA interactions for Protein: Q03880

PKR1, V-type ATPase assembly factor PKR1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PKR1Q03880 ERR3YMR323W 1314 nt6.68□□□□□ -1.34
PKR1Q03880 ERR1YOR393W 1314 nt6.68□□□□□ -1.34
PKR1Q03880 ERR2YPL281C 1314 nt6.68□□□□□ -1.34
PKR1Q03880 PAU16YKL224C 372 nt6.67□□□□□ -1.34
PKR1Q03880 SPE4YLR146C 903 nt6.67□□□□□ -1.34
PKR1Q03880 LEA1YPL213W 717 nt6.67□□□□□ -1.34
PKR1Q03880 FCY21YER060W 1587 nt6.66□□□□□ -1.34
PKR1Q03880 YLR279WYLR279W 390 nt6.66□□□□□ -1.34
PKR1Q03880 HXT13YEL069C 1695 nt6.65□□□□□ -1.34
PKR1Q03880 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt6.65□□□□□ -1.34
PKR1Q03880 YMR253CYMR253C 1245 nt6.65□□□□□ -1.34
PKR1Q03880 SUV3YPL029W 2214 nt6.64□□□□□ -1.35
PKR1Q03880 NUC1YJL208C 990 nt6.64□□□□□ -1.35
PKR1Q03880 HAP5YOR358W 729 nt6.64□□□□□ -1.35
PKR1Q03880 YNL040WYNL040W 1371 nt6.64□□□□□ -1.35
PKR1Q03880 HXT9YJL219W 1704 nt6.64□□□□□ -1.35
PKR1Q03880 ABP1YCR088W 1779 nt6.64□□□□□ -1.35
PKR1Q03880 AQR1YNL065W 1761 nt6.64□□□□□ -1.35
PKR1Q03880 CDC13YDL220C 2775 nt6.63□□□□□ -1.35
PKR1Q03880 MAS2YHR024C 1449 nt6.63□□□□□ -1.35
PKR1Q03880 RAS2YNL098C 969 nt6.62□□□□□ -1.35
PKR1Q03880 YER152CYER152C 1332 nt6.61□□□□□ -1.35
PKR1Q03880 ERG6YML008C 1152 nt6.61□□□□□ -1.35
PKR1Q03880 MET1YKR069W 1782 nt6.61□□□□□ -1.35
PKR1Q03880 ERG13YML126C 1476 nt6.6□□□□□ -1.35
PKR1Q03880 SAM50YNL026W 1455 nt6.6□□□□□ -1.35
PKR1Q03880 MSB3YNL293W 1902 nt6.6□□□□□ -1.35
PKR1Q03880 THI3YDL080C 1830 nt6.6□□□□□ -1.35
PKR1Q03880 YGR012WYGR012W 1182 nt6.6□□□□□ -1.35
PKR1Q03880 ADH6YMR318C 1083 nt6.6□□□□□ -1.35
PKR1Q03880 YPL264CYPL264C 1062 nt6.6□□□□□ -1.35
PKR1Q03880 MSB4YOL112W 1479 nt6.6□□□□□ -1.35
PKR1Q03880 CSM1YCR086W 573 nt6.58□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 SDH5YOL071W 489 nt6.58□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 RPN14YGL004C 1254 nt6.57□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 ELO1YJL196C 933 nt6.57□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt6.57□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt6.57□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 YMC2YBR104W 990 nt6.57□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 MET13YGL125W 1803 nt6.57□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 WSC4YHL028W 1818 nt6.56□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 snR86snR86 1004 nt6.55□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 EAF3YPR023C 1206 nt6.55□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 FCP1YMR277W 2199 nt6.54□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 CKI1YLR133W 1749 nt6.54□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 BAP3YDR046C 1815 nt6.54□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 POB3YML069W 1659 nt6.54□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 SAM3YPL274W 1764 nt6.54□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 RPT5YOR117W 1305 nt6.53□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 RAD23YEL037C 1197 nt6.53□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 RRT6YGL146C 936 nt6.53□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 OYE2YHR179W 1203 nt6.53□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 PRY1YJL079C 900 nt6.53□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 YNR064CYNR064C 873 nt6.53□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 CRC1YOR100C 984 nt6.53□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 HIS3YOR202W 663 nt6.53□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 YBL111CYBL111C 2004 nt6.53□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 SGF73YGL066W 1974 nt6.53□□□□□ -1.36
PKR1Q03880 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt6.52□□□□□ -1.37
PKR1Q03880 APS2YJR058C 444 nt6.52□□□□□ -1.37
PKR1Q03880 GGA2YHR108W 1758 nt6.52□□□□□ -1.37
PKR1Q03880 RRT8YOL048C 1029 nt6.51□□□□□ -1.37
PKR1Q03880 HEL1YKR017C 1656 nt6.51□□□□□ -1.37
PKR1Q03880 NDE2YDL085W 1638 nt6.5□□□□□ -1.37
PKR1Q03880 KEL3YPL263C 1956 nt6.49□□□□□ -1.37
PKR1Q03880 MRS4YKR052C 915 nt6.49□□□□□ -1.37
PKR1Q03880 RPL2AYFR031C-A 765 nt6.48□□□□□ -1.37
PKR1Q03880 ESS1YJR017C 513 nt6.48□□□□□ -1.37
PKR1Q03880 SMM1YNR015W 1155 nt6.48□□□□□ -1.37
PKR1Q03880 AAC3YBR085W 924 nt6.48□□□□□ -1.37
PKR1Q03880 YCR061WYCR061W 1896 nt6.47□□□□□ -1.37
PKR1Q03880 YKR018CYKR018C 2178 nt6.47□□□□□ -1.37
PKR1Q03880 RIB7YBR153W 735 nt6.46□□□□□ -1.38
PKR1Q03880 KGD2YDR148C 1392 nt6.45□□□□□ -1.38
PKR1Q03880 RIB3YDR487C 627 nt6.45□□□□□ -1.38
PKR1Q03880 YJL118WYJL118W 660 nt6.45□□□□□ -1.38
PKR1Q03880 SWT21YNL187W 1074 nt6.44□□□□□ -1.38
PKR1Q03880 TPS1YBR126C 1488 nt6.43□□□□□ -1.38
PKR1Q03880 DDI1YER143W 1287 nt6.43□□□□□ -1.38
PKR1Q03880 snR31snR31 225 nt6.42□□□□□ -1.38
PKR1Q03880 BNA3YJL060W 1335 nt6.42□□□□□ -1.38
PKR1Q03880 TIF3YPR163C 1311 nt6.42□□□□□ -1.38
PKR1Q03880 PPS1YBR276C 2424 nt6.41□□□□□ -1.38
PKR1Q03880 PMT1YDL095W 2454 nt6.41□□□□□ -1.38
PKR1Q03880 LYS20YDL182W 1287 nt6.41□□□□□ -1.38
PKR1Q03880 YER137CYER137C 447 nt6.41□□□□□ -1.38
PKR1Q03880 TMA23YMR269W 636 nt6.41□□□□□ -1.38
PKR1Q03880 ECM27YJR106W 2178 nt6.41□□□□□ -1.38
PKR1Q03880 SEC24YIL109C 2781 nt6.4□□□□□ -1.38
PKR1Q03880 RPL12BYDR418W 498 nt6.4□□□□□ -1.38
PKR1Q03880 YLR030WYLR030W 792 nt6.4□□□□□ -1.38
PKR1Q03880 YLR111WYLR111W 333 nt6.4□□□□□ -1.38
PKR1Q03880 SMC5YOL034W 3282 nt6.39□□□□□ -1.39
PKR1Q03880 MRN1YPL184C 1839 nt6.39□□□□□ -1.39
PKR1Q03880 CRN1YLR429W 1956 nt6.39□□□□□ -1.39
PKR1Q03880 VRG4YGL225W 1014 nt6.39□□□□□ -1.39
PKR1Q03880 IMO32YGR031W 1029 nt6.39□□□□□ -1.39
PKR1Q03880 LSB3YFR024C-A 1380 nt6.39□□□□□ -1.39
PKR1Q03880 OPI3YJR073C 621 nt6.38□□□□□ -1.39
PKR1Q03880 YJR114WYJR114W 393 nt6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.2 ms