Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VLDLRP98155 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VLDLRP98155 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VLDLRP98155 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VLDLRP98155 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VLDLRP98155 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VLDLRP98155 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VLDLRP98155 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VLDLRP98155 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VLDLRP98155 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VLDLRP98155 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VLDLRP98155 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VLDLRP98155 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VLDLRP98155 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VLDLRP98155 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VLDLRP98155 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VLDLRP98155 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VLDLRP98155 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VLDLRP98155 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VLDLRP98155 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VLDLRP98155 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VLDLRP98155 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VLDLRP98155 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VLDLRP98155 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VLDLRP98155 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VLDLRP98155 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VLDLRP98155 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VLDLRP98155 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VLDLRP98155 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VLDLRP98155 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VLDLRP98155 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VLDLRP98155 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VLDLRP98155 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130 ms