Protein–RNA interactions for Protein: P67809

YBX1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1P67809 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YBX1P67809 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
YBX1P67809 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
YBX1P67809 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
YBX1P67809 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
YBX1P67809 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
YBX1P67809 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
YBX1P67809 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
YBX1P67809 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
YBX1P67809 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
YBX1P67809 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
YBX1P67809 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
YBX1P67809 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
YBX1P67809 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
YBX1P67809 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
YBX1P67809 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
YBX1P67809 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
YBX1P67809 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
YBX1P67809 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
YBX1P67809 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
YBX1P67809 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
YBX1P67809 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
YBX1P67809 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
YBX1P67809 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
YBX1P67809 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
YBX1P67809 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
YBX1P67809 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
YBX1P67809 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
YBX1P67809 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YBX1P67809 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YBX1P67809 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YBX1P67809 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YBX1P67809 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
YBX1P67809 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
YBX1P67809 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YBX1P67809 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YBX1P67809 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YBX1P67809 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YBX1P67809 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YBX1P67809 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YBX1P67809 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YBX1P67809 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YBX1P67809 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YBX1P67809 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
YBX1P67809 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YBX1P67809 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YBX1P67809 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YBX1P67809 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YBX1P67809 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YBX1P67809 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YBX1P67809 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YBX1P67809 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YBX1P67809 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
YBX1P67809 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
YBX1P67809 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
YBX1P67809 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
YBX1P67809 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YBX1P67809 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YBX1P67809 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
YBX1P67809 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
YBX1P67809 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YBX1P67809 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
YBX1P67809 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
YBX1P67809 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YBX1P67809 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YBX1P67809 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YBX1P67809 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YBX1P67809 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YBX1P67809 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YBX1P67809 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
YBX1P67809 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YBX1P67809 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
YBX1P67809 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
YBX1P67809 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
YBX1P67809 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YBX1P67809 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YBX1P67809 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YBX1P67809 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YBX1P67809 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YBX1P67809 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YBX1P67809 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YBX1P67809 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YBX1P67809 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YBX1P67809 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
YBX1P67809 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
YBX1P67809 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YBX1P67809 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YBX1P67809 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YBX1P67809 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YBX1P67809 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YBX1P67809 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YBX1P67809 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
YBX1P67809 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
YBX1P67809 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
YBX1P67809 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YBX1P67809 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YBX1P67809 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YBX1P67809 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YBX1P67809 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YBX1P67809 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms