Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS25P62851 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS25P62851 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS25P62851 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS25P62851 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS25P62851 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS25P62851 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS25P62851 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS25P62851 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS25P62851 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS25P62851 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS25P62851 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS25P62851 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS25P62851 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS25P62851 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS25P62851 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS25P62851 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS25P62851 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS25P62851 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS25P62851 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS25P62851 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS25P62851 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS25P62851 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS25P62851 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS25P62851 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS25P62851 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS25P62851 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS25P62851 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS25P62851 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS25P62851 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS25P62851 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS25P62851 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS25P62851 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS25P62851 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS25P62851 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS25P62851 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS25P62851 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS25P62851 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS25P62851 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS25P62851 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS25P62851 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS25P62851 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS25P62851 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS25P62851 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS25P62851 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS25P62851 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS25P62851 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS25P62851 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS25P62851 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS25P62851 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS25P62851 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS25P62851 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS25P62851 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS25P62851 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS25P62851 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS25P62851 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS25P62851 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS25P62851 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS25P62851 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS25P62851 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS25P62851 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS25P62851 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS25P62851 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS25P62851 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS25P62851 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS25P62851 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS25P62851 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS25P62851 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS25P62851 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS25P62851 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS25P62851 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS25P62851 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS25P62851 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS25P62851 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS25P62851 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS25P62851 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS25P62851 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS25P62851 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS25P62851 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS25P62851 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS25P62851 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS25P62851 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS25P62851 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS25P62851 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS25P62851 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS25P62851 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS25P62851 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS25P62851 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS25P62851 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS25P62851 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS25P62851 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS25P62851 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS25P62851 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS25P62851 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS25P62851 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS25P62851 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS25P62851 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS25P62851 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS25P62851 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS25P62851 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms