Protein–RNA interactions for Protein: P62837

UBE2D2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D2P62837 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2D2P62837 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2D2P62837 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2D2P62837 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2D2P62837 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2D2P62837 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2D2P62837 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2D2P62837 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2D2P62837 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2D2P62837 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2D2P62837 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2D2P62837 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2D2P62837 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2D2P62837 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2D2P62837 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2D2P62837 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2D2P62837 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2D2P62837 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2D2P62837 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2D2P62837 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2D2P62837 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2D2P62837 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2D2P62837 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2D2P62837 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2D2P62837 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2D2P62837 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2D2P62837 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2D2P62837 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2D2P62837 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2D2P62837 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2D2P62837 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2D2P62837 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2D2P62837 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2D2P62837 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2D2P62837 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2D2P62837 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2D2P62837 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2D2P62837 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2D2P62837 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2D2P62837 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2D2P62837 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2D2P62837 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2D2P62837 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2D2P62837 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBE2D2P62837 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms