Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBASH3AP57075 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBASH3AP57075 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBASH3AP57075 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBASH3AP57075 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBASH3AP57075 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBASH3AP57075 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBASH3AP57075 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBASH3AP57075 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBASH3AP57075 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBASH3AP57075 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBASH3AP57075 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBASH3AP57075 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBASH3AP57075 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBASH3AP57075 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBASH3AP57075 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBASH3AP57075 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBASH3AP57075 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBASH3AP57075 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBASH3AP57075 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBASH3AP57075 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBASH3AP57075 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBASH3AP57075 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBASH3AP57075 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBASH3AP57075 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBASH3AP57075 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBASH3AP57075 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBASH3AP57075 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBASH3AP57075 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBASH3AP57075 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBASH3AP57075 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBASH3AP57075 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
UBASH3AP57075 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBASH3AP57075 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBASH3AP57075 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBASH3AP57075 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
UBASH3AP57075 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
UBASH3AP57075 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBASH3AP57075 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBASH3AP57075 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBASH3AP57075 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBASH3AP57075 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBASH3AP57075 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBASH3AP57075 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBASH3AP57075 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBASH3AP57075 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBASH3AP57075 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBASH3AP57075 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBASH3AP57075 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBASH3AP57075 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBASH3AP57075 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBASH3AP57075 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBASH3AP57075 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBASH3AP57075 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBASH3AP57075 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBASH3AP57075 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBASH3AP57075 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBASH3AP57075 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms