Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTCP1P56278 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTCP1P56278 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTCP1P56278 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTCP1P56278 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTCP1P56278 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTCP1P56278 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTCP1P56278 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTCP1P56278 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms