Protein–RNA interactions for Protein: P55289

CDH12, Cadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH12P55289 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH12P55289 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH12P55289 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH12P55289 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH12P55289 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH12P55289 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH12P55289 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH12P55289 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH12P55289 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH12P55289 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH12P55289 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH12P55289 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH12P55289 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH12P55289 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH12P55289 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH12P55289 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH12P55289 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH12P55289 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH12P55289 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDH12P55289 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH12P55289 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH12P55289 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH12P55289 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH12P55289 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH12P55289 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH12P55289 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH12P55289 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH12P55289 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH12P55289 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH12P55289 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH12P55289 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH12P55289 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH12P55289 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH12P55289 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH12P55289 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH12P55289 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH12P55289 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH12P55289 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH12P55289 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH12P55289 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH12P55289 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH12P55289 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH12P55289 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH12P55289 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH12P55289 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH12P55289 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH12P55289 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH12P55289 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH12P55289 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH12P55289 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH12P55289 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH12P55289 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH12P55289 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH12P55289 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH12P55289 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH12P55289 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH12P55289 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH12P55289 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH12P55289 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH12P55289 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH12P55289 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH12P55289 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH12P55289 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH12P55289 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH12P55289 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH12P55289 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH12P55289 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH12P55289 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH12P55289 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH12P55289 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDH12P55289 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH12P55289 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH12P55289 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH12P55289 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH12P55289 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH12P55289 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH12P55289 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH12P55289 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH12P55289 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDH12P55289 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDH12P55289 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDH12P55289 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDH12P55289 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDH12P55289 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH12P55289 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH12P55289 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH12P55289 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH12P55289 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH12P55289 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH12P55289 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH12P55289 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH12P55289 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH12P55289 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH12P55289 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH12P55289 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH12P55289 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH12P55289 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH12P55289 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH12P55289 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH12P55289 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms