Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRISP3P54108 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRISP3P54108 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRISP3P54108 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRISP3P54108 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRISP3P54108 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRISP3P54108 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRISP3P54108 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRISP3P54108 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CRISP3P54108 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CRISP3P54108 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRISP3P54108 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRISP3P54108 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRISP3P54108 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRISP3P54108 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRISP3P54108 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRISP3P54108 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CRISP3P54108 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRISP3P54108 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRISP3P54108 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRISP3P54108 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRISP3P54108 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRISP3P54108 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRISP3P54108 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRISP3P54108 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRISP3P54108 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRISP3P54108 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRISP3P54108 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRISP3P54108 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251.2 ms