Protein–RNA interactions for Protein: P53158

KXD1, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit KXD1, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
KXD1P53158 TRP4YDR354W 1143 nt9.2□□□□□ -0.94
KXD1P53158 MAD2YJL030W 591 nt9.2□□□□□ -0.94
KXD1P53158 HIF1YLL022C 1158 nt9.2□□□□□ -0.94
KXD1P53158 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt9.2□□□□□ -0.94
KXD1P53158 SPR1YOR190W 1338 nt9.2□□□□□ -0.94
KXD1P53158 ILV2YMR108W 2064 nt9.19□□□□□ -0.94
KXD1P53158 CYT2YKL087C 675 nt9.19□□□□□ -0.94
KXD1P53158 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt9.19□□□□□ -0.94
KXD1P53158 ERV41YML067C 1059 nt9.19□□□□□ -0.94
KXD1P53158 RFC1YOR217W 2586 nt9.19□□□□□ -0.94
KXD1P53158 MGR3YMR115W 1506 nt9.19□□□□□ -0.94
KXD1P53158 SED1YDR077W 1017 nt9.18□□□□□ -0.94
KXD1P53158 YOL079WYOL079W 399 nt9.18□□□□□ -0.94
KXD1P53158 DBP1YPL119C 1854 nt9.18□□□□□ -0.94
KXD1P53158 DAL2YIR029W 1032 nt9.17□□□□□ -0.94
KXD1P53158 CTK2YJL006C 972 nt9.17□□□□□ -0.94
KXD1P53158 ADD66YKL206C 804 nt9.17□□□□□ -0.94
KXD1P53158 SUT1YGL162W 900 nt9.16□□□□□ -0.94
KXD1P53158 RPF2YKR081C 1035 nt9.16□□□□□ -0.94
KXD1P53158 BTS1YPL069C 1008 nt9.16□□□□□ -0.94
KXD1P53158 YBR292CYBR292C 372 nt9.16□□□□□ -0.94
KXD1P53158 KRE28YDR532C 1158 nt9.15□□□□□ -0.94
KXD1P53158 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.15□□□□□ -0.94
KXD1P53158 PCL6YER059W 1263 nt9.14□□□□□ -0.95
KXD1P53158 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.14□□□□□ -0.95
KXD1P53158 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.14□□□□□ -0.95
KXD1P53158 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.14□□□□□ -0.95
KXD1P53158 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.14□□□□□ -0.95
KXD1P53158 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.14□□□□□ -0.95
KXD1P53158 YET2YMR040W 483 nt9.13□□□□□ -0.95
KXD1P53158 VPS20YMR077C 666 nt9.13□□□□□ -0.95
KXD1P53158 MRPS8YMR158W 468 nt9.13□□□□□ -0.95
KXD1P53158 LIP1YMR298W 453 nt9.13□□□□□ -0.95
KXD1P53158 YIF1YNL263C 945 nt9.13□□□□□ -0.95
KXD1P53158 PCL1YNL289W 840 nt9.13□□□□□ -0.95
KXD1P53158 RRP17YDR412W 708 nt9.12□□□□□ -0.95
KXD1P53158 SKI6YGR195W 741 nt9.12□□□□□ -0.95
KXD1P53158 CUS2YNL286W 858 nt9.12□□□□□ -0.95
KXD1P53158 SLM4YBR077C 489 nt9.12□□□□□ -0.95
KXD1P53158 HXT1YHR094C 1713 nt9.11□□□□□ -0.95
KXD1P53158 NPP1YCR026C 2229 nt9.11□□□□□ -0.95
KXD1P53158 AIM2YAL049C 741 nt9.11□□□□□ -0.95
KXD1P53158 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt9.1□□□□□ -0.95
KXD1P53158 ISY1YJR050W 708 nt9.1□□□□□ -0.95
KXD1P53158 YNR048WYNR048W 1182 nt9.1□□□□□ -0.95
KXD1P53158 YAP7YOL028C 738 nt9.1□□□□□ -0.95
KXD1P53158 YBL086CYBL086C 1401 nt9.1□□□□□ -0.95
KXD1P53158 FCY21YER060W 1587 nt9.1□□□□□ -0.95
KXD1P53158 YDR306CYDR306C 1437 nt9.09□□□□□ -0.95
KXD1P53158 ENT5YDR153C 1236 nt9.09□□□□□ -0.95
KXD1P53158 SAM1YLR180W 1149 nt9.09□□□□□ -0.95
KXD1P53158 GFD1YMR255W 567 nt9.09□□□□□ -0.95
KXD1P53158 RRP15YPR143W 753 nt9.09□□□□□ -0.95
KXD1P53158 MED2YDL005C 1296 nt9.08□□□□□ -0.96
KXD1P53158 YNL228WYNL228W 777 nt9.08□□□□□ -0.96
KXD1P53158 DCP1YOL149W 696 nt9.08□□□□□ -0.96
KXD1P53158 GND1YHR183W 1470 nt9.08□□□□□ -0.96
KXD1P53158 HMRA1YCR097W 381 nt9.07□□□□□ -0.96
KXD1P53158 YEA4YEL004W 1029 nt9.07□□□□□ -0.96
KXD1P53158 CMP2YML057W 1815 nt9.07□□□□□ -0.96
KXD1P53158 LEU9YOR108W 1815 nt9.07□□□□□ -0.96
KXD1P53158 RMD5YDR255C 1266 nt9.06□□□□□ -0.96
KXD1P53158 APT2YDR441C 546 nt9.06□□□□□ -0.96
KXD1P53158 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt9.06□□□□□ -0.96
KXD1P53158 SSP2YOR242C 1116 nt9.06□□□□□ -0.96
KXD1P53158 RAD17YOR368W 1206 nt9.06□□□□□ -0.96
KXD1P53158 YPL251WYPL251W 303 nt9.06□□□□□ -0.96
KXD1P53158 YER138W-AYER138W-A 105 nt9.05□□□□□ -0.96
KXD1P53158 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt9.05□□□□□ -0.96
KXD1P53158 YAT1YAR035W 2064 nt9.04□□□□□ -0.96
KXD1P53158 ATG29YPL166W 642 nt9.04□□□□□ -0.96
KXD1P53158 UGA4YDL210W 1716 nt9.03□□□□□ -0.96
KXD1P53158 MMS2YGL087C 414 nt9.03□□□□□ -0.96
KXD1P53158 OAC1YKL120W 975 nt9.03□□□□□ -0.96
KXD1P53158 LOT5YKL183W 921 nt9.03□□□□□ -0.96
KXD1P53158 PGC1YPL206C 966 nt9.03□□□□□ -0.96
KXD1P53158 YKR015CYKR015C 1707 nt9.02□□□□□ -0.96
KXD1P53158 BUD31YCR063W 474 nt9.02□□□□□ -0.97
KXD1P53158 GCV1YDR019C 1203 nt9.02□□□□□ -0.97
KXD1P53158 SHY1YGR112W 1170 nt9.02□□□□□ -0.97
KXD1P53158 TDH1YJL052W 999 nt9.02□□□□□ -0.97
KXD1P53158 TAF11YML015C 1041 nt9.02□□□□□ -0.97
KXD1P53158 BRR1YPR057W 1026 nt9.02□□□□□ -0.97
KXD1P53158 ZRT3YKL175W 1512 nt9.01□□□□□ -0.97
KXD1P53158 SAS4YDR181C 1446 nt9.01□□□□□ -0.97
KXD1P53158 SMM1YNR015W 1155 nt9.01□□□□□ -0.97
KXD1P53158 EHD3YDR036C 1503 nt9□□□□□ -0.97
KXD1P53158 YBR138CYBR138C 1575 nt9□□□□□ -0.97
KXD1P53158 TCA17YEL048C 459 nt9□□□□□ -0.97
KXD1P53158 YPI1YFR003C 468 nt9□□□□□ -0.97
KXD1P53158 GTR1YML121W 933 nt9□□□□□ -0.97
KXD1P53158 BAG7YOR134W 1230 nt9□□□□□ -0.97
KXD1P53158 OCA4YCR095C 1089 nt8.99□□□□□ -0.97
KXD1P53158 YPL277CYPL277C 1464 nt8.99□□□□□ -0.97
KXD1P53158 CDS1YBR029C 1374 nt8.99□□□□□ -0.97
KXD1P53158 UFO1YML088W 2007 nt8.98□□□□□ -0.97
KXD1P53158 OKP1YGR179C 1221 nt8.98□□□□□ -0.97
KXD1P53158 SAW1YAL027W 786 nt8.98□□□□□ -0.97
KXD1P53158 SPG5YMR191W 1122 nt8.98□□□□□ -0.97
KXD1P53158 MEP3YPR138C 1470 nt8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.3 ms