Protein–RNA interactions for Protein: P48723

HSPA13, Heat shock 70 kDa protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA13P48723 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA13P48723 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HSPA13P48723 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSPA13P48723 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSPA13P48723 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSPA13P48723 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSPA13P48723 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSPA13P48723 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSPA13P48723 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSPA13P48723 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSPA13P48723 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSPA13P48723 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSPA13P48723 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSPA13P48723 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSPA13P48723 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSPA13P48723 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSPA13P48723 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSPA13P48723 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HSPA13P48723 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSPA13P48723 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSPA13P48723 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSPA13P48723 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSPA13P48723 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSPA13P48723 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSPA13P48723 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSPA13P48723 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSPA13P48723 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSPA13P48723 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSPA13P48723 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSPA13P48723 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSPA13P48723 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSPA13P48723 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSPA13P48723 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSPA13P48723 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSPA13P48723 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSPA13P48723 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSPA13P48723 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSPA13P48723 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms