Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGFRP43088 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGFRP43088 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGFRP43088 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGFRP43088 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGFRP43088 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGFRP43088 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTGFRP43088 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGFRP43088 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGFRP43088 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms