Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 ELO1YJL196C 933 nt8.19□□□□□ -1.1
YAR028WP39548 YNR064CYNR064C 873 nt8.19□□□□□ -1.1
YAR028WP39548 LEU4YNL104C 1860 nt8.19□□□□□ -1.1
YAR028WP39548 AIM41YOR215C 558 nt8.18□□□□□ -1.1
YAR028WP39548 RIB2YOL066C 1776 nt8.17□□□□□ -1.1
YAR028WP39548 MCM5YLR274W 2328 nt8.17□□□□□ -1.1
YAR028WP39548 YHP1YDR451C 1062 nt8.17□□□□□ -1.1
YAR028WP39548 YJR114WYJR114W 393 nt8.17□□□□□ -1.1
YAR028WP39548 ADE8YDR408C 645 nt8.16□□□□□ -1.1
YAR028WP39548 YPI1YFR003C 468 nt8.16□□□□□ -1.1
YAR028WP39548 ILV2YMR108W 2064 nt8.16□□□□□ -1.1
YAR028WP39548 HAP5YOR358W 729 nt8.16□□□□□ -1.1
YAR028WP39548 SIR2YDL042C 1689 nt8.15□□□□□ -1.1
YAR028WP39548 YMR244WYMR244W 1068 nt8.15□□□□□ -1.1
YAR028WP39548 YOR072WYOR072W 315 nt8.15□□□□□ -1.1
YAR028WP39548 GET2YER083C 858 nt8.14□□□□□ -1.11
YAR028WP39548 RPN14YGL004C 1254 nt8.14□□□□□ -1.11
YAR028WP39548 LSM12YHR121W 564 nt8.14□□□□□ -1.11
YAR028WP39548 SUV3YPL029W 2214 nt8.14□□□□□ -1.11
YAR028WP39548 KEL3YPL263C 1956 nt8.13□□□□□ -1.11
YAR028WP39548 BNA3YJL060W 1335 nt8.12□□□□□ -1.11
YAR028WP39548 RFC1YOR217W 2586 nt8.12□□□□□ -1.11
YAR028WP39548 OPI3YJR073C 621 nt8.12□□□□□ -1.11
YAR028WP39548 OCA1YNL099C 717 nt8.12□□□□□ -1.11
YAR028WP39548 DAK2YFL053W 1776 nt8.12□□□□□ -1.11
YAR028WP39548 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.11□□□□□ -1.11
YAR028WP39548 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.11□□□□□ -1.11
YAR028WP39548 YDR467CYDR467C 327 nt8.11□□□□□ -1.11
YAR028WP39548 MRS3YJL133W 945 nt8.11□□□□□ -1.11
YAR028WP39548 NPP2YEL016C 1482 nt8.11□□□□□ -1.11
YAR028WP39548 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.1□□□□□ -1.11
YAR028WP39548 DTR1YBR180W 1719 nt8.09□□□□□ -1.11
YAR028WP39548 YNR029CYNR029C 1290 nt8.09□□□□□ -1.11
YAR028WP39548 FET5YFL041W 1869 nt8.09□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 TVP23YDR084C 600 nt8.07□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 CRC1YOR100C 984 nt8.07□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 snR31snR31 225 nt8.07□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 PCL10YGL134W 1302 nt8.06□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 SFL1YOR140W 2301 nt8.06□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 YCR049CYCR049C 447 nt8.05□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.05□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.05□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.05□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.05□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.05□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.05□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.05□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.05□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.05□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.05□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.05□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.05□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.05□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.05□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.05□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 SWT21YNL187W 1074 nt8.05□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 NPL6YMR091C 1308 nt8.04□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 MPC1YGL080W 393 nt8.04□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 SNZ1YMR096W 894 nt8.04□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt8.04□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 YPR126CYPR126C 309 nt8.04□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 MRPL36YBR122C 534 nt8.04□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 RBG2YGR173W 1107 nt8.03□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 MIM1YOL026C 342 nt8.03□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 YPR150WYPR150W 522 nt8.03□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 GTB1YDR221W 2109 nt8.03□□□□□ -1.12
YAR028WP39548 MET1YKR069W 1782 nt8.02□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 MEX67YPL169C 1800 nt8.02□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 MMS21YEL019C 804 nt8.02□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 GPM1YKL152C 744 nt8.02□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 TAF4YMR005W 1167 nt8.02□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 YNL234WYNL234W 1281 nt8.02□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 ADH1YOL086C 1047 nt8.02□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 SPS100YHR139C 981 nt8.01□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 CWC25YNL245C 540 nt8.01□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 YBL095WYBL095W 813 nt8.01□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 COA2YPL189C-A 207 nt8.01□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 ALG7YBR243C 1347 nt8□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 MTO1YGL236C 2010 nt8□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 HBS1YKR084C 1836 nt7.99□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 RRP1YDR087C 837 nt7.99□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 TRP2YER090W 1524 nt7.98□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 KGD2YDR148C 1392 nt7.98□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 YPL168WYPL168W 1293 nt7.98□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 IML3YBR107C 738 nt7.98□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 MLS1YNL117W 1665 nt7.98□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 GAT1YFL021W 1533 nt7.98□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 THI6YPL214C 1623 nt7.97□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 YLR460CYLR460C 1131 nt7.97□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 YPL277CYPL277C 1464 nt7.97□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 HXT11YOL156W 1704 nt7.97□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 THI3YDL080C 1830 nt7.96□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 CCT5YJR064W 1689 nt7.96□□□□□ -1.13
YAR028WP39548 URA8YJR103W 1737 nt7.96□□□□□ -1.14
YAR028WP39548 GGA2YHR108W 1758 nt7.95□□□□□ -1.14
YAR028WP39548 AMF1YOR378W 1548 nt7.95□□□□□ -1.14
YAR028WP39548 YER147C-AYER147C-A 411 nt7.95□□□□□ -1.14
YAR028WP39548 YKL053WYKL053W 375 nt7.95□□□□□ -1.14
YAR028WP39548 AAT1YKL106W 1356 nt7.95□□□□□ -1.14
YAR028WP39548 CTI6YPL181W 1521 nt7.94□□□□□ -1.14
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