Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP214P35658 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP214P35658 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP214P35658 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP214P35658 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP214P35658 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP214P35658 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP214P35658 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP214P35658 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP214P35658 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP214P35658 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP214P35658 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP214P35658 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP214P35658 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP214P35658 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP214P35658 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP214P35658 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP214P35658 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP214P35658 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP214P35658 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP214P35658 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP214P35658 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP214P35658 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP214P35658 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP214P35658 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP214P35658 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP214P35658 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP214P35658 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP214P35658 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP214P35658 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP214P35658 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP214P35658 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP214P35658 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP214P35658 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP214P35658 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP214P35658 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP214P35658 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP214P35658 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP214P35658 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP214P35658 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP214P35658 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP214P35658 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP214P35658 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP214P35658 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP214P35658 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP214P35658 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP214P35658 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP214P35658 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP214P35658 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP214P35658 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP214P35658 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP214P35658 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP214P35658 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP214P35658 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP214P35658 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP214P35658 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP214P35658 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP214P35658 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP214P35658 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP214P35658 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP214P35658 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP214P35658 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP214P35658 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP214P35658 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP214P35658 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP214P35658 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP214P35658 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP214P35658 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP214P35658 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP214P35658 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP214P35658 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP214P35658 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP214P35658 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP214P35658 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP214P35658 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP214P35658 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP214P35658 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP214P35658 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP214P35658 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP214P35658 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP214P35658 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP214P35658 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP214P35658 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP214P35658 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP214P35658 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP214P35658 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP214P35658 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP214P35658 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP214P35658 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP214P35658 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP214P35658 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP214P35658 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP214P35658 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP214P35658 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP214P35658 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP214P35658 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP214P35658 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP214P35658 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP214P35658 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP214P35658 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms