Protein–RNA interactions for Protein: P30939

HTR1F, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1FP30939 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTR1FP30939 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTR1FP30939 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTR1FP30939 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR1FP30939 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR1FP30939 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR1FP30939 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR1FP30939 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR1FP30939 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR1FP30939 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR1FP30939 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR1FP30939 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR1FP30939 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR1FP30939 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR1FP30939 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR1FP30939 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR1FP30939 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR1FP30939 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR1FP30939 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR1FP30939 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR1FP30939 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR1FP30939 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR1FP30939 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR1FP30939 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR1FP30939 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR1FP30939 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HTR1FP30939 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR1FP30939 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTR1FP30939 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms