Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX2P28328 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX2P28328 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX2P28328 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX2P28328 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX2P28328 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX2P28328 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX2P28328 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX2P28328 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX2P28328 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX2P28328 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX2P28328 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX2P28328 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX2P28328 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX2P28328 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX2P28328 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX2P28328 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX2P28328 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX2P28328 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX2P28328 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX2P28328 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX2P28328 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX2P28328 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX2P28328 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX2P28328 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX2P28328 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX2P28328 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX2P28328 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX2P28328 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX2P28328 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX2P28328 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX2P28328 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX2P28328 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX2P28328 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PEX2P28328 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PEX2P28328 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX2P28328 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX2P28328 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX2P28328 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX2P28328 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX2P28328 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX2P28328 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX2P28328 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX2P28328 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX2P28328 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX2P28328 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX2P28328 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX2P28328 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX2P28328 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX2P28328 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX2P28328 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX2P28328 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX2P28328 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX2P28328 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX2P28328 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX2P28328 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX2P28328 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX2P28328 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX2P28328 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX2P28328 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX2P28328 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX2P28328 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX2P28328 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX2P28328 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX2P28328 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX2P28328 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX2P28328 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX2P28328 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX2P28328 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX2P28328 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX2P28328 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX2P28328 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX2P28328 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX2P28328 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX2P28328 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX2P28328 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX2P28328 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX2P28328 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX2P28328 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX2P28328 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX2P28328 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX2P28328 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX2P28328 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX2P28328 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX2P28328 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX2P28328 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX2P28328 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX2P28328 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX2P28328 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX2P28328 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX2P28328 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX2P28328 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX2P28328 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX2P28328 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PEX2P28328 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PEX2P28328 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX2P28328 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX2P28328 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX2P28328 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX2P28328 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms